Journal
/
Biology
/
Generere transposon innsetting biblioteker i Gram-negative bakterier for høy gjennomstrømning sekvensering
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Generating Transposon Insertion Libraries in Gram-Negative Bacteria for High-Throughput Sequencing

Generere transposon innsetting biblioteker i Gram-negative bakterier for høy gjennomstrømning sekvensering

DOI:
10.3791/61612-v

•

08:19 min

•

July 07, 2020

•

, ,
1Department of Biology,University of Texas at Arlington

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:57Bacterial Mating
  • 02:47Generation of Final Bacterial Mutant Library
  • 04:11DNA Shearing and Poly-C Tail Addition
  • 06:23Results: Transposon Mutant Library
  • 07:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver en metode for å generere mettende transposonmutantbiblioteker i Gram-negative bakterier og påfølgende fremstilling av DNA amplicon biblioteker for høy gjennomstrømning sekvensering. Som et eksempel fokuserer vi på ESKAPE-patogenet, Acinetobacter baumannii,men denne protokollen er mottagelig for et bredt spekter av Gram-negative organismer.

Tags

Transposon Insertion LibraryGram-negative BacteriaHigh-throughput SequencingEssential GenesAntibiotic ResistanceIn Vivo FitnessMechanical ShearingPoly-CTLRestriction EnzymesAdapter LigationBacterial GeneticsGenotype-phenotype RelationshipsMatingDiaminopimelic AcidGlycerolFrozen Stock

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

A High Throughput Screen for Biomining Cellulase Activity from Metagenomic Libraries

Competitive Genomic Screens of Barcoded Yeast Libraries

High-throughput Saccharification Assay for Lignocellulosic Materials

Generasjon av høy kvalitet Chromatin immunoprecipitation DNA Mal for High-throughput sekvensering (ChIP-seq)

Meget Effektiv Ligering av små RNA molekyler for mikroRNA kvantifisering av høy gjennomstrømming Sequencing

Utvinning av Voksen sebrafisk Hearts for høy gjennomstrømming Applications

Høy gjennomstrømming Screening for kjemi modulatorer av Post-transcriptionally Regulerte Gener

En protokoll for funksjonell vurdering av Whole-Protein metning Mutagenese Biblioteker Utnytte høy gjennomstrømming sekvense

Høy gjennomstrømming Screening for Protein-basert arv i S. cerevisiae

Modifiserte metoder for lasting av DNA-ekstraksjonsplater med høy gjennomstrømning reduserer potensialet for kontaminering

Read Article