يفصل البروتوكول الحالي عزل الفيكوبيليزومات من البكتيريا الزرقاء عن طريق الطرد المركزي من خلال تدرج كثافة السكروز المتقطع. يتم تأكيد أجزاء من الفيكوبيليسومات السليمة من خلال طيف انبعاثات الفلورسنت 77K وتحليل SDS-PAGE. الكسور الفيزيائية الناتجة مناسبة للتلطيخ السلبي ل TEM وتحليل الطيف الكتلي.