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Article de méthode

Détection de la mitophagie chez Caenorhabditis elegans et des cellules de mammifères à l’aide de colorants spécifiques aux organites

3.5K vues

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DOI :

10.3791/65337

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19 mai 2023

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Dans cet article

Résumé

L’exploration de la mitophagie par microscopie électronique, capteurs génétiques et immunofluorescence nécessite un équipement coûteux, du personnel qualifié et un investissement en temps important. Ici, nous démontrons l’efficacité d’un kit de colorant de fluorescence commercial pour quantifier le processus de mitophagie à la fois chez Caenorhabditis elegans et dans une lignée cellulaire de cancer du foie.

Résumé

Les mitochondries sont essentielles à diverses fonctions biologiques, notamment la production d’énergie, le métabolisme des lipides, l’homéostasie du calcium, la biosynthèse de l’hème, la mort cellulaire régulée et la génération d’espèces réactives de l’oxygène (ROS). Les ROS sont vitales pour les processus biologiques clés. Cependant, lorsqu’ils ne sont pas contrôlés, ils peuvent entraîner des lésions oxydatives, y compris des dommages mitochondriaux. Les mitochondries endommagées libèrent plus de ROS, intensifiant ainsi les lésions cellulaires et l’état de la maladie. Un processus homéostatique appelé autophagie mitochondriale (mitophagie) élimine sélectivement les mitochondries endommagées, qui sont ensuite remplacées par de nouvelles. Il existe plusieurs voies de mitophagie, le critère d’évaluation commun étant la dégradation des mitochondries endommagées dans les lysosomes.

Plusieurs méthodologies, y compris les capteurs génétiques, l’immunofluorescence des anticorps et la microscopie électronique, utilisent ce paramètre pour quantifier la mitophagie. Chaque méthode d’examen de la mitophagie a ses avantages, tels que le ciblage tissulaire/cellulaire spécifique (avec des capteurs génétiques) et un grand détail (avec la microscopie électronique). Cependant, ces méthodes nécessitent souvent des ressources coûteuses, du personnel formé et un long temps de préparation avant l’expérience réelle, par exemple pour créer des animaux transgéniques. Ici, nous présentons une alternative rentable pour mesurer la mitophagie en utilisant des colorants fluorescents disponibles dans le commerce ciblant les mitochondries et les lysosomes. Cette méthode mesure efficacement la mitophagie chez le nématode Caenorhabditis elegans et les cellules hépatiques humaines, ce qui indique son efficacité potentielle dans d’autres systèmes modèles.

Introduction

Les mitochondries sont essentielles pour tous les animaux aérobies, y compris les humains. Ils convertissent l’énergie chimique des biomolécules en adénosine triphosphate (ATP) via la phosphorylation oxydative1, synthétisent l’hème2, dégradent les acides gras par oxydationβ 3, régulent l’homéostasie du calcium4 et du fer5 , contrôlent la mort cellulaire par apoptose6 et génèrent des espèces réactives de l’oxygène (ROS), qui jouent un rôle vital dans l’homéostasie redox7. Deux processus compléme....

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Protocole

NOTE: Pour la commodité des lecteurs, nous avons divisé le protocole en deux parties: l’une se concentre sur le protocole de mesure de la mitophagie chez C. elegans, et l’autre se concentre sur le protocole de mesure de la mitophagie dans les cellules hépatiques. La liste des matériaux se trouve dans le tableau des matériaux fourni.

1. Le protocole C. elegans

  1. Préparation des plaques de milieu de croissance des nématodes (NGM) et du stock bactérien OP50 d’Escherichia coli
    NOTE: À titre de clarification, bien que nous ayons suivi les protocoles standard pour la préparat....

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Résultats

Induction d’une réponse de mitophagie robuste chez les vers C . elegans et les cellules Hep-3B avec VL-850
VL-850 protège les vers C. elegans et les kératinocytes humains (cellules HaCaT) du stress oxydatif23. Pour explorer davantage son mécanisme d’action, nous avons examiné si le VL-850 induit la mitophagie chez C. elegans et d’autres cellules humaines. Pour tester cela, nous avons exposé des vers C. elegans (jeunes adultes, 3 jours après L.......

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Discussion

Les voies de mitophagie multiples impliquent diverses protéines et biomolécules (par exemple, cardiolipine29). Cependant, le point final de ces voies est similaire - la dégradation des mitochondries par les enzymes lysosomales12,13. En effet, plusieurs méthodes utilisent ce paramètre pour quantifier la mitophagie. Cependant, certaines méthodes, telles que la microscopie électronique, nécessitent l’accès à un équipement coûteux, à des exper.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à déclarer.

Remerciements

Nous remercions les membres du laboratoire Gross pour la lecture critique du manuscrit et leurs commentaires et conseils. Nous remercions le Caenorhabditis Genetics Center (CGC), qui est financé par le National Institutes of Health Office of Research Infrastructure Programs (P40 OD010440), pour avoir fourni certaines des souches. Cette recherche a été financée par une subvention de Vitalunga Ltd et de la Fondation israélienne pour la science (subvention n° 989/19). La figure abstraite graphique (Figure 1) a été générée avec BioRender.com.

....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Réactif ou ressource
Balance analytiqueMettler-Toledo
Bacto AgarBD-Difco214010
Bacto PeptoneBD-Difco211677
Bacto TryptoneBD-Difco211705
Bacto Extrait de levureBD-Difco212750
Chlorurede calcium SigmaC1016
Cyanure de carbonyle 4-(trifluorométhoxy)phénylhydrazone (FCCP)SigmaC2920
Chemicals
CholestrolThermo FisherC/5360/48
DMEM high glucoseBiological Industries01-055-1A
Eau double distillée (DDW)Dulbecco’s
Phosphate Buffered Saline (PBS)Biological Industries02-023-1A
FBS heat inactivatedInvitrogenM7514
Gluteradehyde (25 %)SigmaG5882
HEPES Buffer 1 MBiological Industries03-025-1B
L-gluatamineBiological Industries03-020-1B
Lysosome/Mitochondries/Coloration nucléaire Cytopainter RéactifAbcamab139487
Sulfate de magnésiumSigmaM7506
Nonidet P 40Sigma74385
Paraformalydéhyde (16 %)Microscopie électronique Sciences15720
Poloxamer 188 SolutionSigmaP5556
Dihydrogénophosphate de potassiumMillipore1.04873.1000
Phosphate de potassium dibasiqueSigmaP3786
SeaKem LE AgaroseLonza50004
Chlorurede sodium Bio-Lab1903059100
Hydroxyde de sodiumGadot1310732
Phosphate de sodium dodécahydrate dibasiqueSigma4273
Chlorhydrate de tétracyclineSigma87128-25G
Trypsine-EDTABiological Industries03-052-1A
VL-850 : 1,8-diaminooxy-octaneBreveté<
fort>Verre/Plastique jetables
0.22 &mu ; Filtre à seringueMillex GVSLGV033RS
1,7 mL Micro Tubes à centrifugerLifegeneLMCT1.7B-500
10 cm Plaques de PétriCorning430167
1 000 mL Erlenmeyer FlaskIsoLab, Allemagne
15 mL Tube stérile en polypropylèneLifegeneLTB15-500
35 mm Boîtes de PétriBar Naor
500  ; mL système de filtre/bouteille de stockage, 0,22  ; &mu ; mLifegeneLG-FPE205500S
50 mL Tube stérile en polypropylèneLifegeneLTB50-500
Deckglä ; ser Verre de protection de microscope 24 x 60 mmMarienfeld101152
Tubes à essai en verre (10 mL- 13 x 100 mm) Verre borosilicatéPyrex99445-13
iBiDi 8 lames de puitsiBiDi80826
Verre de protection de microscope 24 x 40 mmBar NaorBN1052421ECALN
Platine iridium 0,25 mM filWorld Precision InstrumentsPT1002
Instruments
Cell Drop BFDeNovixCellDrop BF-UNLTD
Microspin FV-2400BiosanBS-010201-AAA
Microscope confocal Nikon Yokogawa W1 Spinning Disk avec filtres DAPI, FITC et TRITC et fond clair, avec un objectif de type 60x CFI Plan-Apochromat Lambda (lentille à air) et le logicielNIS-ElementsNikonCSU-W1
Olympus SZ61 StéréomicroscopeOlympusSZ61
PH-mètreMettler-ToledoMT30019032
Revolver Rotateur de laboratoire réglableLabnetH5600
BN9015810 Compteur de cellules

Références

  1. Westermann, B. Molecular machinery of mitochondrial fusion and fission. Journal of Biological Chemistry. 283 (20), 13501-13505 (2008).
  2. Piel, R. B., Dailey, H. A., Medlock, A. E. The mitochondrial heme metabolon: Insig....

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Réimpressions et autorisations

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