Journal
/
/
Автоматизированный анализ Шолл оцифрованных нейронов морфологии в различных масштабах
JoVE Journal
Neuroscience
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Neuroscience
Automated Sholl Analysis of Digitized Neuronal Morphology at Multiple Scales
DOI:

11:41 min

November 14, 2010

, , , ,

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:20Introduction
  • 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
  • 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
  • 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
  • 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
  • 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
  • 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
  • 11:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Мы разработали компьютерную программу для анализа нейронной морфологии. В сочетании с двумя существующими открытыми инструменты анализа источников, наша программа выполняет Шолл анализа и определяет количество невриты, точек ветвления и аксонов советы. Анализы выполняются так, что локальные изменения в морфологии аксонов можно наблюдать.

Related Videos

Read Article