/
/
Automatiserad Sholl Analys av digitaliserade Neuronal Morfologi på flera skalor
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:00Title
- 00:20Introduction
- 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
- 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
- 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
- 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
- 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
- 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
- 11:21Conclusion
Vi har utvecklat ett datorprogram för att analysera neuronal morfologi. I kombination med två befintliga öppen källkod analys, utför vårt program Sholl analys och fastställer antalet neurites, förgreningar och tips neurite. Analyserna utförs så att lokala förändringar i neurite morfologi kan observeras.
Tags
Automated Sholl AnalysisDigitized Neuronal MorphologyMultiple ScalesNeuronsFunctionCommunicationInputsAction PotentialsNeuritesInformation ProcessingDendrite MorphologiesSignalingSpecialized FunctionsNeuronal NetworkAlterations In MorphologyFragmentationBranching PatternsDisease StatesAlzheimer’s DiseaseSchizophreniaMental RetardationFactors Shaping Dendrite MorphologiesNervous System Function And DysfunctionSholl AnalysisCounting Neurites And Branch TipsAxonsTime-consuming AnalysisVariabilityExperimenter BiasInconsistencyBonfire Program
