इस प्रोटोकॉल मस्तिष्क thromboemboli visualizing के लिए संयुक्त लगभग अवरक्त फ्लोरोसेंट (NIRF) इमेजिंग और सूक्ष्म गणना टोमोग्राफी (microCT) के आवेदन का वर्णन है। इस तकनीक thrombus बोझ और विकास की मात्रा का ठहराव की अनुमति देता है। NIRF इमेजिंग तकनीक fluorescently, excised मस्तिष्क में थक्का लेबल visualizes जबकि microCT तकनीक सोने-नैनोकणों का उपयोग कर रहने वाले जानवरों के अंदर thrombus visualizes।