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Sitio de Integración Retroviral Bidireccional Metodología de PCR y Flujo de Trabajo de Análisis de Datos Cuantitativos
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow
DOI:

12:53 min

June 14, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 01:11LTR-specific Biotin-primer Extension
  • 02:53Rsal and CviQI Digestion and Blunt-ending
  • 04:12Straptavidin Bead Binding
  • 05:31Linker Ligation
  • 06:39Pre-amplification of Both Left and Right Junction DNA
  • 08:15Left- and Right-junction-specific Amplifications
  • 10:23Results: The IS Bidirectional Assay Improves Detection Rates and Sequence Quantification Accuracy
  • 12:09Conclusion

Summary

Automatic Translation

Este manuscrito describe el procedimiento experimental y el análisis de software para un ensayo de sitio de integración bidireccional que puede analizar simultáneamente el ADN de unión vector-huésped aguas arriba y aguas abajo. Los productos de PCR bidireccionales pueden utilizarse para cualquier plataforma de secuenciación aguas abajo. Los datos resultantes son útiles para una comparación cuantitativa de alto rendimiento de dianas de ADN integradas.

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