Journal
/
Biochemistry
/
Dyp proteom profilering av isobar merking, omfattende flytende Ture, massespektrometri og Software-baserte kvantifisering
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Dyp proteom profilering av isobar merking, omfattende flytende Ture, massespektrometri og Software-baserte kvantifisering

DOI:
10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

, , , , , , ,
1St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Heilongjiang University of Chinese Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:00Preparation of Cells/Tissues
  • 01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
  • 04:45TMT Labeling of Peptides
  • 05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
  • 06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
  • 07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
  • 08:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi presenterer en protokoll for nøyaktig quantitate proteiner med isobar merking, omfattende fraksjoneres, Bioinformatikk verktøy og kvalitet skritt i kombinasjon med flytende kromatografi interfaced til en høy oppløsning masse spectrometer.

Tags

Proteome ProfilingIsobaric LabelingLiquid ChromatographyMass SpectrometryQuantificationProtein IdentificationProtein QuantitationBiomarker DiscoveryCell LysisProtein DigestionAcetonitrileLys-C ProteaseDTTHEPES

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Sheathless Kapillær elektroforese-massespektrometri for Metabolsk profilering av biologiske prøver

Time-løst elektrospray-ionisering Hydrogen-deuterium Veksling massespektrometri for å studere Protein struktur og dynamikk

Løse affinitetsrenset protein komplekser av Blå Native PAGE og Protein korrelasjon Profiling

Et tandem-væskekromatografi-massespektrometri basert tilnærming for Metabolitt Analyse av<em> Staphylococcus aureus</em

Påvisning av protein ubiquitination nettsteder av peptid berikelse og masse spektrometri

Proteom hele kvantifisering av merking homogenitet på ett molekyl nivå

Nitropeptide profilering og identifisering illustrert av angiotensin II

Absolutt kvantifisering av Cell-fri protein syntese metabolisme av reversert-fase flytende kromatografi-Mass massespektrometri

Label-fri Immunutfelling masse massespektrometri arbeidsflyt for stor skala kjernefysisk Interactome profilering

Kvantitativ analyse av cellulær lipidom eav saccharomyces cerevisiae ved hjelp av flytende kromatografi kombinert med tandem massespektrometri

Read Article