Journal
/
Genetics
/
Disseksjon Enhancer funksjon med Multiplex CRISPR-baserte Enhancer forstyrrelser i linjer
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines

Disseksjon Enhancer funksjon med Multiplex CRISPR-baserte Enhancer forstyrrelser i linjer

DOI:
10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

, ,
1Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokollen beskriver fremgangsmåten for å utforme og utføre multiplex målretting av enhancers med deaktivering fusion protein SID4X-dCas9-KRAB, også kjent som forsterker interferens (Enhancer-i). Dette aktiverer identifisering av enhancers som regulerer genuttrykk og forenkler Disseksjon av relasjoner mellom enhancers regulere et felles mål-gen.

Tags

Keywords: CRISPREnhancer InterferenceGene RegulationTranscriptionGuide RNA DesignE-CRISPUCSC Genome BrowserBLATGenome AssemblyOff-targetProtospacer-adjacent MotifGenomics

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57883?article_type=v

RNA interferens-basert undersøkelse av funksjon av Heat Shock Protein 27 under hornhinneepitel Wound Healing
check_url/57883?article_type=v

Encellede Gene Expression Bruke Multiplex RT-qPCR å karakter heterogenitet av sjeldne lymfoide populasjoner
check_url/57883?article_type=v

Påvisning av Kopier nummer Endringer Bruke enkelt celle Sequencing
check_url/57883?article_type=v

Kromatinimmunpresipitasjon (ChIP) i mus-T-cellelinjer
check_url/57883?article_type=v

Bruke musen Oocytes å vurdere menneskelige gen funksjon under meiose jeg
check_url/57883?article_type=v

Genomet redigering i pattedyr linjer med CRISPR-Cas
check_url/57883?article_type=v

Manipulering av gen funksjon i meksikansk Cavefish
check_url/57883?article_type=v

Masse massespektrometri-baserte Proteomikk analyser bruker OpenProt databasen å avsløre romanen proteiner oversatt fra ikke-kanoniske åpent lesing rammer
check_url/57883?article_type=v

Designing automatisert, høy gjennomstrømming, kontinuerlig cellevekst eksperimenter bruke eVOLVER
check_url/57883?article_type=v

Samlede CRISPR-baserte genetiske skjermer i pattedyrceller

Read Article