Journal
/
Genetics
/
Dissectie van Enhancer functie met behulp van Multiplex CRISPR gebaseerde Enhancer inmenging in cellijnen
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Dissectie van Enhancer functie met behulp van Multiplex CRISPR gebaseerde Enhancer inmenging in cellijnen

DOI:
10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

, ,
1Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dit protocol beschrijft de stappen die nodig zijn voor het ontwerpen en uitvoeren multiplexed targeting van versterkers met de deactivering fusieproteïne SID4X-dCas9-KRAB, ook bekend als enhancer interferentie (Enhancer-i). Dit protocol stelt de identificatie van versterkers die regelen van genexpressie en vergemakkelijkt de dissectie van de relaties tussen de versterkers van regulering van een gemeenschappelijk doel-gen.

Tags

Keywords: CRISPREnhancer InterferenceGene RegulationTranscriptionGuide RNA DesignE-CRISPUCSC Genome BrowserBLATGenome AssemblyOff-targetProtospacer-adjacent MotifGenomics

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57883?article_type=v

RNA-interferentie op basis van onderzoek naar de functie van heat shock protein 27 tijdens cornea epitheliale wondheling
check_url/57883?article_type=v

Eencellige genexpressie met behulp van Multiplex RT-qPCR heterogeniteit van Rare lymfoïde populaties karakteriseren
check_url/57883?article_type=v

Detectie van Copy Number Wijzigingen met behulp van Single Cell Sequencing
check_url/57883?article_type=v

Chromatine Immunoprecipitatie (ChIP) in Muis T-cellijnen
check_url/57883?article_type=v

Met behulp van de muis eicellen te beoordelen van menselijke genfunctie tijdens de meiose I
check_url/57883?article_type=v

Genoom bewerken in zoogdieren cellijnen met behulp van CRISPR-Cas
check_url/57883?article_type=v

Manipulatie van de genfunctie in Mexicaanse Cavefish
check_url/57883?article_type=v

Massa spectrometrie gebaseerde Proteomics Analyses met behulp van de OpenProt Database te onthullen nieuwe eiwitten vertaald uit niet-canonieke Open lezing Frames
check_url/57883?article_type=v

Het ontwerpen van geautomatiseerde, high-throughput, continue celgroei experimenten met behulp van evolver
check_url/57883?article_type=v

Gepoolde CRISPR-gebaseerde genetische schermen in zoogdiercellen

Read Article