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Dissezione della funzione Enhancer usando Multiplex basati su CRISPR Enhancer interferenze nelle linee cellulari
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Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines
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Dissezione della funzione Enhancer usando Multiplex basati su CRISPR Enhancer interferenze nelle linee cellulari

DOI:
10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

, ,
1Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Questo protocollo descrive i passaggi necessari per progettare e realizzare targeting multiplex di esaltatori con la proteina di fusione disattivazione SID4X-dCas9-KRAB, noto anche come interferenza di enhancer (Enhancer-i). Questo protocollo consente l'identificazione dei rinforzatori che regolano l'espressione genica e facilita la dissezione delle relazioni tra esaltatori di un gene bersaglio comune di regolazione.

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Keywords: CRISPREnhancer InterferenceGene RegulationTranscriptionGuide RNA DesignE-CRISPUCSC Genome BrowserBLATGenome AssemblyOff-targetProtospacer-adjacent MotifGenomics

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