Journal
/
Biology
/
אנליזה microbiota באמצעות שני שלבים PCR ו-הדור הבא של 16 rRNA גן רצף
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

אנליזה microbiota באמצעות שני שלבים PCR ו-הדור הבא של 16 rRNA גן רצף

DOI:
10.3791/59980-v

•

11:22 min

•

October 15, 2019

•

, , ,
1Department of Pathology,University of Iowa, 2Medical Scientist Training Program,University of Iowa, 3Graduate Program in Immunology,University of Iowa, 4Graduate Program in Molecular Medicine,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

מתוארים כאן הוא הליך סטנדרטי הפעלה פשוטה עבור הפרופיל microbiome באמצעות רצף מטאגנמית של 16S וניתוח באמצעות כלים זמינים בחופשיות. פרוטוקול זה יסייע לחוקרים החדשים לשדה microbiome, כמו גם אלה הדורשים עדכונים על שיטות להשיג פרופיל חיידקי ברזולוציה גבוהה יותר.

Tags

MicrobiomeMicrobiota16S RRNA Gene SequencingNext-generation SequencingFecal SampleDNA ExtractionPCRGut MicrobiomeMicrobial Profiling

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

פלואורסצנטי, מיקרוסקופ הקרנת ואת הדור הבא הרצף: כלים שימושיים לזיהוי גנים המעורבים אברון Integrity

רצף של הדור הבא של 16S ריבוזומלי amplicons ג'ין RNA

ממוקד DNA מתילציה ניתוח על ידי רצף של הדור הבא

הגברה, רצף הדור הבא, ואת הגנום מיפוי ה- DNA של אתרי אינטגרצית retroviral

הפקת חומצות גרעין יעיל 16S rRNA ג'ין רצף עבור בקטריאלי קהילת אפיון

פרוטוקול מודרך לקבלת צואה אפיון חיידקים על ידי מטוסי אף-16 rRNA-אמפליקון רצף

Interactome-Seq: פרוטוקול עבור ספריית Domainome ובניה, אימות בחירה Phage התצוגה ורצף הדור הבא

אפיון Microbiome שנתות על-ידי מטוסי אף-16 הדור הבא rRNA אמפליקון רצף

פרוטוקולי PCR דיגיטליים טיפתיים דו-שלביים של תמלול לאחור לזיהוי וכימות SARS-CoV-2

פרוטוקול מיצוי DNA יתוש מבוסס חרוז מגנטי לרצף הדור הבא

Read Article