Dette manuskript præsenterer en protokol til at fremkalde aktiv eksperimentel autoimmun encephalomyelitis (EAE) i mus. En metode til isolering og karakterisering af de infiltrerede lymfocytter i centralnervesystemet (CNS) præsenteres også for at vise, hvordan lymfocytter er involveret i udviklingen af CNS autoimmun sygdom.