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使用纳米流体技术的单体和散装 C. 电子样品 中的高通量定量 RT-PCR

JoVE Journal
Genetics

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High-Throughput Quantitative RT-PCR in Single and Bulk C. elegans Samples Using Nanofluidic Technology

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使用纳米流体技术的单体和散装 C. 电子样品中的高通量定量 RT-PCR

DOI:

10.3791/61132-v

•

08:19 min

•

May 28, 2020

•

Laetitia Chauve*¹, Jérémie Le Pen*^2,3,5, Francesca Hodge, Pia Todtenhaupt, Laura Biggins, Eric A. Miska^3,4, Simon Andrews, Olivia Casanueva

¹Babraham Institute, ²Gurdon Institute,University of Cambridge, ³Department of Genetics,University of Cambridge, ⁴Wellcome Trust Genome Campus,Wellcome Trust Sanger Institute, ⁵Laboratory of Virology and Infectious Disease,The Rockefeller University

Chapters

00:05Introduction
00:46Worm-to-CT Worm Lysis
02:08Reverse Transcription (RT) for Bulk Samples
02:38Target Specific Preamplification
03:19Exonuclease I Treatment
03:53Sample Mix Preparation
04:48Nanofluidic Chip Priming and Loading
06:00Results: Representative Worm-to-CT Analysis
07:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

本文描述了一个高通量协议，用于快速、可靠地确定单个或批量 C.elegans 样本中的基因表达水平。此协议不需要 RNA 隔离，并且直接从样品中生成 cDNA。它可以与高通量多路复用纳米流体实时 qPCR 平台一起使用。

Tags

RT-qPCR C. Elegans Nanofluidic Technology High-throughput Single-sample Bulk-sample RNA Isolation Lysis Buffer Reverse Transcription Pre-amplification Gene Expression Interindividual Variability

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