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Mapeando as Relações Estrutura-Função de Fatores de Transcrição Oncogênica Desordenados usando análise transcriômica
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Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis

Mapeando as Relações Estrutura-Função de Fatores de Transcrição Oncogênica Desordenados usando análise transcriômica

DOI:
10.3791/61564-v

•

09:58 min

•

June 27, 2020

•

, , , , ,
1Center for Childhood Cancer and Blood Diseases,Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children’s Hospital, 2Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program,The Ohio State University, 3Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant,The Ohio State University, 4Department of Pediatrics,The Ohio State University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Domínios intrinsecamente desordenados são importantes para a função do fator de transcrição de fusão oncogênica. Para atingir terapeuticamente essas proteínas, é necessário uma compreensão mais detalhada dos mecanismos regulatórios utilizados por esses domínios. Aqui, usamos transcrição para mapear características estruturais importantes do domínio EWS intrinsecamente desordenado no sarcoma Ewing.

Tags

TranscriptomicsStructure-function AnalysisDisordered Transcription FactorsOncogenic Fusion ProteinsEWS/FLIPartial Function DetectionRNA SequencingCDNA ExpressionVirus TransductionCell CultureSelectionProtein Extraction

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