Journal
/
/
Отображение структурно-функциональных отношений неупорядоченных онкогенных факторов транскрипции с использованием транскриптомного анализа
JoVE Journal
Cancer Research
This content is Free Access.
JoVE Journal Cancer Research
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
DOI:

09:58 min

June 27, 2020

, , , , ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Внутренне неупорядоченные домены важны для функции фактора транскрипции онкогенного слияния. Чтобы терапевтически нацелиться на эти белки, требуется более подробное понимание регуляторных механизмов, используемых этими доменами. Здесь мы используем транскриптомику для отображения важных структурных особенностей внутренне неупорядоченного домена EWS в саркоме Юинга.

Related Videos

Read Article