Nous décrivons ici un protocole pour caractériser les interactions protéine-protéine entre deux protéines fortement exprimées différemment dans pseudomonas aeruginosa vivants utilisant des mesures de FLIM-FRET. Le protocole comprend les constructions de souches bactériennes, l’immobilisation des bactéries, l’imagerie et les routines d’analyse des données post-imagerie.