यह प्रोटोकॉल ट्रिपैनोसोमाटिड संक्रमण के दौरान मेटाबोलाइट वितरण के 3 डी मॉडल को उत्पन्न करने के चरणों का वर्णन करता है, जिसमें नमूना संग्रह, मेटाबोलाइट निष्कर्षण, तरल क्रोमैटोग्राफी-टैंडेम मास स्पेक्ट्रोमेट्री डेटा अधिग्रहण, 3 डी मॉडल पीढ़ी का अवलोकन और अंत में, डेटा विज़ुअलाइज़ेशन शामिल है।