न्यूरोपेप्टाइड्स के मास स्पेक्ट्रोमेट्रिक लक्षण वर्णन अनुक्रम, मात्रा और स्थानीयकरण जानकारी प्रदान करता है। यह अनुकूलित वर्कफ़्लो न केवल न्यूरोपेप्टाइड अध्ययनों के लिए उपयोगी है, बल्कि अन्य अंतर्जात पेप्टाइड्स के लिए भी उपयोगी है। यहां प्रदान किए गए प्रोटोकॉल नमूना तैयारी, एमएस अधिग्रहण, एमएस विश्लेषण, और एलसी-ईएसआई-एमएस, मालडी-एमएस स्पॉटिंग और मालडी-एमएस इमेजिंग का उपयोग करके न्यूरोपेप्टाइड्स के डेटाबेस उत्पादन का वर्णन करते हैं।