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Aquí, presentamos un protocolo para el análisis conductual de una metodología de aprendizaje basada en proyectos para estudiantes de ciencias de la salud (20-56 años). El protocolo facilita la comparación del desempeño de los participantes en e-Learning versus blended-Learning (b-Learning) a través de una herramienta de monitoreo. Los resultados se analizan utilizando Minería de Datos Educativos y técnicas cualitativas.