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암 후성유전학 연구를 위한 ATAC-Seq 최적화
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Cancer Research
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JoVE Journal Cancer Research
ATAC-Seq Optimization for Cancer Epigenetics Research
DOI:

07:13 min

June 30, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:04Cell Lysis and Tn5 Tagmentation
  • 01:52DNA Purification
  • 02:57PCR Amplification
  • 03:43Beads Purification
  • 04:26Results: Comparison of TSS Enrichment Scores and Differential Peaks Obtained Using Optimized Cell‐Lysis Buffers, Cell Number Input, and Tn5 Concentration of ATAC‐Seq Libraries
  • 06:33Conclusion

Summary

Automatic Translation

ATAC-seq는 과민성 돌연변이 트랜스포자제 Tn5를 사용하여 전사 인자에 의해 매개되는 염색질 접근성의 변화를 매핑하는 DNA 시퀀싱 방법입니다. ATAC-seq는 암세포의 표현형 변화의 기초가되는 분자 메커니즘의 발견을 가능하게합니다. 이 프로토콜은 암세포를 포함한 상피 세포 유형에서 ATAC-seq에 대한 최적화 절차를 간략하게 설명합니다.

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