É necessária uma assinatura do JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou inicie seu teste gratuito.

Artigo de método

Um Método de Trigonometria Modelagem da Variação Sazonal demonstrado com esclerose múltipla Relapse Dados

10.5K visualizações

⸱

DOI:

10.3791/53169

⸱

9 de dezembro de 2015

 ,  ,  , 

Neste artigo

Resumo

Combinar a análise de gráficos com a regressão trigonométrica é um método robusto para explorar fenômenos complexos e cíclicos, como o tempo de início da recidiva na esclerose múltipla (EM). Este método permitiu a caracterização imparcial das tendências sazonais no início da recaída, permitindo novas inferências em torno da influência da variação sazonal, radiação ultravioleta (UVR) e latitude.

Resumo

Este relatório descreve uma nova aplicação baseada em Stata de modelagem de regressão trigonométrica para 55 anos de dados de recidiva de esclerose múltipla de 46 centros clínicos em 20 países localizados em ambos os hemisférios. Central para o sucesso deste método foi o uso estratégico da análise de gráficos para orientar e corroborar a modelagem de regressão estatística. A análise inicial do gráfico foi necessária para estabelecer hipóteses realistas sobre a presença e a forma estrutural das influências sazonais e latitudinais na probabilidade de recaída e, em seguida, testar o desempenho dos modelos resultantes. A regressão trigonométrica foi então necessária para quantificar essas relações, ajustar fatores de confusão importantes e fornecer uma medida de certeza sobre o quão plausíveis eram essas associações. A sincronização das técnicas gráficas com a modelagem de regressão permitiu um refinamento sistemático dos modelos até que a convergência de melhor ajuste fosse alcançada, permitindo que novas inferências fossem feitas sobre a influência independente da estação e da latitude na previsão do tempo de início da recidiva na EM. Esses métodos têm o potencial de aplicação em outras doenças complexas e fenômenos epidemiológicos suspeitos ou conhecidos por variar sistematicamente com a estação e/ou localização geográfica.

Introdução

A forma mais comum de esclerose múltipla (EM) é remitente da esclerose múltipla (EMRR). EMRR é caracterizada por deteriorações episódicas na função neurológica, seguida por uma recuperação parcial ou completa. Globalmente, a incidência ea prevalência da SM com o aumento da distância aumentar longe do equador em ambos os hemisférios. 1-3 Se a freqüência de eventos de recaída que ocorrem especificamente na EMRR também variam com a latitude, e se há qualquer variação sazonal subjacente em tal associação, permanece obscuro. Para estudos de data explorando sazonalidade no tempo de recaída foram limitadas aos centros clínicos individuais, limitando quaisquer inf....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Protocolo

NOTA: Cada passo descrito corresponde a uma seção do código Stata com o mesmo número no arquivo de código fornecido. Nomes de comando stata foram itálico no seguinte protocolo.

1. Prepare e Traçar a Observado Relapse Onset Dados

  1. Abra um arquivo de fazer clicando no botão "Editor do New Do arquivo" e use o comando gerar para calcular o número de inícios de recaída datadas para cada um dos doze meses do calendário para cada um dos três níveis geográficos para ser modelada: localização, hemisfério e global. Comando de ação clicando no botão "Executar (fazer)" do-arquivo de ação no arquivo do.
  2. Use a sw....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Resultados

A aplicação de regressão trigonométrico para 32,762 eventos de recaída provenientes de 46 centros clínicos em 20 países foi a base para a prestação de um argumento estatístico defensável para a observação de que o momento de início recaída em MS é cíclica e sazonal em ambos os hemisférios e que a duração entre sazonal trough UVR e subsequente pico recaída se correlaciona com a latitude. Fundamental para isso foi a confiança em análise enredo para orientar o processo de desenvolvimento iterativo necessariamente modelo, a.......

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Discussão

O protocolo aqui descrito detalhes uma técnica baseada regressão sistemática, orientada por análise enredo visual, de dados de início recaída MS globais. Ele toma como ponto de partida uma análise descritiva relativamente simples de dados de recaída de 20 países em toda a ambos os hemisférios, permitindo ao usuário explorar teorias a respeito da temporalidade de timing início recaída em MS e testar essas teorias formalmente através do uso de modelos trigonométricas. Através de um processo passo a passo de primeira plota.......

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Divulgações

Tim Spelman recebeu honorários para consultoria e financiamento para viagens de Biogen Idec Inc; Orla cinza recebeu apoio viagens de Biogen Idec, Merck Serono e Novartis; compensação para servir em conselhos consultivos científicos da Biogen Idec, Genzyme, Novartis e Merck Serono; Robyn Lucas não revelou quaisquer interesses concorrentes e Helmut Butzkueven recebeu uma compensação para servir em conselhos consultivos científicos e como consultor para a Biogen Idec e Novartis; honorários altifalantes a partir da Biogen Idec Austrália, Merck Serono Austrália, e Novartis Austrália; apoio da Biogen Idec Austrália e Merck Serono Austrália viajar; apoio para pesquisa da Fundação CASS (Austrália), Merck Serono Austrália, Hospital Royal Melbourne Amigos da Fundação Neurociências, e da Universidade de Melbourne.

Agradecimentos

Os autores gostariam de agradecer a Ivan Hanigan por seu apoio na extração e interpretação dos dados de satélite de radiação ultravioleta. O trabalho foi apoiado pelo Prêmio de Desenvolvimento de Carreira do NHMRC (Clínico) para HB [ID628856], NHMRC Project Grant [1032484], NHMRC Center for Research Excellence [Grant ID 1001216] e a Fundação MSBase. A MSBase Foundation é uma organização sem fins lucrativos que recebe apoio da Merck Serono, Biogen Idec, Novartis Pharma, Bayer-Schering, Sanofi-Aventis e BioCSL. RL é apoiado por um Prêmio de Desenvolvimento de Carreira do NHMRC [ID 1004898].

....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Stata SE Versão 13StataCorp, College Station, TexasVersão 13Software de análise estatística usado para análise
Microsoft Excel 2010Microsoft2010Programa de planilha para consulta de data de calendário

Referências

  1. Simpson, S. Jr, Blizzard, L., Otahal, P., Van der Mei, I., Taylor, B. Latitude is significantly associated with the prevalence of multiple sclerosis: a meta-analysis. J Neurol Neurosurg Psychiatry. 82 (10), 1132-1141 (2011).
  2. Risco, J., et al.

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Reimpressões e permissões

Explorar mais artigos

Regressão TrigonométricaAnálise de LatitudeTempo de RecaídaSoftware StataModelagem de UVRModelo HarmônicoDeslocamento de FaseVisualização de Dados