Journal
/
Biology
/
RNA secundaire structuur Voorspelling behulp van High-throughput SHAPE
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
RNA Secondary Structure Prediction Using High-throughput SHAPE
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

RNA secundaire structuur Voorspelling behulp van High-throughput SHAPE

DOI:
10.3791/50243-v

•

13:42 min

•

May 31, 2013

•

, , , ,
1RT Biochemistry Section, HIV Drug Resistance Program,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:40RNA Folding
  • 03:09Chemical Modification of the RNA
  • 04:33Reverse Transcription
  • 07:08Preparation of Sequencing Ladder and Capillary Electrophoresis
  • 09:55ShapeFinder Software
  • 11:15Data Normalization
  • 11:51Results: RNA Structure Determination using RNA Structure Software
  • 12:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

High-throughput selectieve 2-hydroxyl acylering geanalyseerd door primerverlenging (SHAPE) gebruikt een nieuwe chemische indringende techniek, reverse transcriptie, capillaire elektroforese en secundaire structuur predictie software om de structuren van RNA bepalen van enkele honderden tot enkele duizenden nucleotiden aan nucleotide resolutie.

Tags

RNA Secondary StructureHigh-throughput SHAPEChemical ProbingReverse TranscriptionCapillary ElectrophoresisShapeFinderRNAStructureIn Silico PredictionSingle Nucleotide Resolution

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

High-throughput gist Plasmide Overexpressie Screen

Een protocol voor Computer-Based Protein Structure en functie Voorspelling

High-throughput Kristallisatie van membraaneiwitten Met behulp van de lipidische Bicelle Method

High-throughput Fysische in kaart brengen van Chromosomen met Automatisch<em> In situ</em> Hybridisatie

High-throughput Functionele Screening met behulp van een zelfgemaakte Dual-gloed Luciferase Assay

A Manual Small Molecule Screen Naderend High-throughput Met behulp van zebravis embryo's

Zeer efficiënte Ligatie van Kleine RNA-moleculen voor MicroRNA Kwantificering van High-throughput sequencing

High-throughput screening voor Chemische Modulators van Post-transcriptioneel gereguleerde genen

Detectie van miRNA Doelen in High-throughput Met de 3'LIFE Assay

Identificatie van de kinase-substraat Paren Met behulp van high throughput screening

Read Article