कई अलग अलग तरीकों फ्लो (FCM) का उपयोग कोशिकी पुटिकाओं (ईवीएस) की माप के लिए मौजूद हैं। उपयोग करने के लिए सबसे उपयुक्त विधि का निर्धारण करते समय कई पहलुओं पर विचार किया जाना चाहिए। मापने ईवीएस के लिए दो प्रोटोकॉल व्यक्ति का पता लगाने या एक मनका-आधारित दृष्टिकोण का उपयोग कर प्रस्तुत कर रहे हैं।