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세균 커뮤니티 특성화에 대한 효율적인 핵산 추출 및 16S rRNA의 유전자 시퀀싱

JoVE Journal
Biology

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JoVE Journal Biology

Efficient Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene Sequencing for Bacterial Community Characterization

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세균 커뮤니티 특성화에 대한 효율적인 핵산 추출 및 16S rRNA의 유전자 시퀀싱

DOI:

10.3791/53939-v

•

12:37 min

•

April 14, 2016

•

Melis N. Anahtar, Brittany A. Bowman, Douglas S. Kwon

¹Ragon Institute of MGH, MIT, and Harvard,Massachusetts General Hospital

Chapters

00:05Title
00:57Extraction of Total Nucleic Acid from Cervicovaginal Swabs (Phenol-Chloroform Extraction)
05:52PCR Amplification of the 16S rRNA Gene V4 Hypervariable Region
09:40Library Pooling and High-Throughput Sequencing
10:30Evaluation of Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene PCR Amplification
11:35Conclusion

Summary

Automatic Translation

우리는 16S rRNA의 유전자의 증폭 시퀀싱을 사용하여 세균 지역 사회의 특성에 대한 면봉에서 핵산을 추출하기위한 효율적이고 강력하고 비용 효과적인 방법을 설명합니다. 이 방법은 여러 종류의 시료에 대한 일반적인 처리 방법을 허용하고 하류 공정 분석들을 수용한다.

Tags

Keywords: Nucleic Acid Extraction 16S RRNA Gene Sequencing Bacterial Community Characterization Swabs DNA RNA Human Samples Body Sites NaCl-Tris-EDTA Buffer SDS Phenol Chloroform Isoamyl Alcohol Bead Beading Homogenization Centrifugation

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