Ved Parkinsons sygdom (PD), sorte substans (SNC) dopaminerge neuroner degenerere, hvilket fører til motorisk dysfunktion. Her rapporterer vi en protokol til dyrkning ventrale midthjernen neuroner fra en mus, der udtrykker eGFP drevet af en tyrosinhydroxylase (TH) promotorsekvens, høst individuelle fluorescerende neuroner fra kulturerne, og måling af deres transkriptom anvendelse af RNA-seq.