Journal
/
Biochemistry
/
ショットガンプロテオミクスにある深さの特徴付けのためLERLIC-MS / MSおよびグルタミンの定量化およびアスパラギン脱アミド
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
LERLIC-MS/MS for In-depth Characterization and Quantification of Glutamine and Asparagine Deamidation in Shotgun Proteomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ショットガンプロテオミクスにある深さの特徴付けのためLERLIC-MS / MSおよびグルタミンの定量化およびアスパラギン脱アミド

DOI:
10.3791/55626-v

•

08:01 min

•

April 09, 2017

•

, ,
1Division of Structural Biology and Biochemistry, School of Biological Sciences,Nanyang Technological University

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:44Long-length Anion-exchange (LAX) Capillary Column Packing
  • 01:43Tissue Sample Preparation
  • 05:33One-dimension Long-length Electrostatic Repulsion-hydrophilic Interaction Chromatography-tandem Mass Spectrometry (LERLIC-MS/MS) Separation and Data Analysis
  • 06:48Results: Separation of Deamidation Isoforms of Glutamine and Asparagine by LERLIC-MS/MS
  • 07:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

ここでは、長尺の静電反発力 - 親水性相互作用クロマトグラフィー - タンデム質量分析（LERLIC-MS / MS）方法のステップバイステップのプロトコルを提示します。これは、ショットガンプロテオミクスによってグルタミンとアスパラギン脱アミド化アイソフォームを初めて定量および特徴付けのために有効に小説の方法論です。

Tags

LERLIC-MS/MSGlutamine DeamidationAsparagine DeamidationShotgun ProteomicsPeptide SeparationAnion Exchange ChromatographyProtein QuantificationDithiothreitolIodoacetamide

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

定圧ラベリング、豊富な液体クロマトグラフィー、質量分析法、およびソフトウェアによる定量化して深いプロテオームをプロファイリング

糖タンパク質 x 線結晶構造解析および生物物理学的手法によって、免疫グロブリンフォールドのキャラクタリゼーション

低親和性受容体-リガンド相互作用のハイスループット検出の細胞外タンパク質マイクロ アレイ技術

ペプチド濃縮と質量分析によるタンパク質ユビキチン化部位の検出

肝癌における相撲プロテオームの濃縮、単離、同定、特性評価のためのツールとしての相撲結合エンティティ(SES)

細胞および組織におけるコエンザイムAの定量

プロテオミクス施設提出のためのTMTサンプル調製とその後のデータ分析

JUMPn:プロテオミクスにおけるタンパク質共発現クラスタリングとネットワーク解析のための合理化されたアプリケーション

オープンソースのラボロボットによるショットガンプロテオミクスサンプル処理

げっ歯類組織のショットガンリピドミクス

Read Article