Journal
/
Genetics
/
Genom-brede kartlegging av protein-DNA-interaksjoner med ChEC-seq i<em> Saccharomyces cerevisiae</em
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions with ChEC-seq in Saccharomyces cerevisiae

Genom-brede kartlegging av protein-DNA-interaksjoner med ChEC-seq i<em> Saccharomyces cerevisiae</em

DOI:
10.3791/55836-v

•

10:43 min

•

June 03, 2017

•

,
1Basic Sciences Division,Fred Hutchinson Cancer Research Center, 2Department of Biology,Indiana University

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Chromatin Endogenous Cleavage (ChEC)
  • 06:30Size Selection
  • 08:28Results: ChEC-seq Enables Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions
  • 09:54Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver kromatin endogen klyvning kombinert med høy gjennomstrømningssekvensering (ChEC-seq), en kromatinimmunpresipitasjon (ChIP) -orthogonal metode for kartlegging av proteinbindingssteder som er genomspredte med mikrokocukleuklease (MNase) fusjonsproteiner.

Tags

ChEC-seqProtein-DNA InteractionsGenome-wide MappingSaccharomyces CerevisiaeTranscriptionChromatinDNA BindingRegulatory FactorsHigh ResolutionLow BackgroundFormaldehyde CrosslinkingChromatin SolubilizationAntibodiesMNaseCalcium AdditionStop SolutionSDS

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Genome-wide Fastsettelse av pattedyr Replication Timing av DNA innhold Measurement

Kartlegging av RNA-RNA-interaksjoner globalt ved bruk av biotinylert psoralen

Kartlegging genomet hele tilgjengelig Chromatin i primære menneskelige T-lymfocytter av ATAC-Seq

Bfu genomet hele transkripsjon forfall i voksende og Quiescent menneskelig fibroblaster

Generasjon av genomet hele Chromatin konformasjon fange biblioteker fra tett trinnvis tidlig Drosophila embryo

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Histone endringer fra Saccharomyces cerevisiae

Promotoren fange Hei-C: Med høy oppløsning, genomet-bred profilering av arrangøren interaksjoner

Genomet hele overvåking av transkripsjon feil i eukaryote organismer

Saccharomyces cerevisiae Metabolsk merking med 4-thiouracil og kvantifisering av nylig syntetisert mRNA som en Proxy for RNA Polymerase II aktivitet

Genetisk kartlegging av Thermotolerance forskjeller mellom arter av Saccharomyces gjær via Genova-bredt gjensidige Hemizygosity Analysis

Read Article