Journal
/
Genetics
/
Generasjon av innfødte Chromatin Immunoprecipitation sekvensering biblioteker til Nucleosome tetthet analyse
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Generasjon av innfødte Chromatin Immunoprecipitation sekvensering biblioteker til Nucleosome tetthet analyse

DOI:
10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

, , , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
  • 03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
  • 08:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi presenterer en modifisert innfødt chromatin immunoprecipitation sekvensering (ChIP-seq) metodikk for generering av sekvens datasett egnet for en nucleosome tetthet ChIP-seq analytiske rammen integrere micrococcal nuclease (MNase) tilgjengelighet med histone endring målinger.

Tags

Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering

Analyse av c-KIT ligand-promotoren ved bruk av kromatinimmunutfelling

Kromatinimmunpresipitasjon (ChIP) i mus-T-cellelinjer

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) protokollen for lav-overflod embryonale prøver

Generasjon av genomet hele Chromatin konformasjon fange biblioteker fra tett trinnvis tidlig Drosophila embryo

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Histone endringer fra Saccharomyces cerevisiae

Chromatin Immunoprecipitation av Murine brun fettvev

Kromatin Immunutfelling analysen bruke Micrococcal Nukleaser i pattedyrceller

Oppdagelse CsgD regulere mål inne Salmonella biofilm benytter kromatin Immunutfelling og høy-produksjon sekvensering (flis-SEQ)

Optimalisering for sekvensering og analyse av degraderte FFPE-RNA-prøver

Read Article