Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double <em>In Vitro</em> Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Anirban Paul; Z. Josh Huang

doi:10.3791/58690

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Einzellige RNA Sequenzierung von Eindringmittel beschrifteten Maus Neuronen mit Handsortierung und doppelte In Vitro Transkription mit absoluten zählt Sequenzierung (DIVA-Seq)

JoVE Journal
Neuroscience

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Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double In Vitro Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

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Einzellige RNA Sequenzierung von Eindringmittel beschrifteten Maus Neuronen mit Handsortierung und doppelte In Vitro Transkription mit absoluten zählt Sequenzierung (DIVA-Seq)

DOI:

10.3791/58690-v

•

07:49 min

•

October 26, 2018

•

Anirban Paul, Z. Josh Huang

¹Cold Spring Harbor Laboratory

Chapters

00:04Title
00:43Preparation for Dissection and Neuron Sorting
02:09Brain Sectioning and Cell Dissociation
04:15Manual Sorting of Fluorescently Labeled Mouse Neurons
05:59Results: Microdissection of GABAergic Neurons
07:24Conclusion

Summary

Automatic Translation

Dieses Protokoll beschreibt das manuelle Sortieren Verfahren, um einzelne Eindringmittel beschrifteten Neuronen, gefolgt von in-vitro- Transkription-basierte mRNA Verstärkung für die hoch-Tiefe einzellige RNA Sequenzierung zu isolieren.

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Non-Laser Capture Microscopy Ansatz für die Mikrodissektion von Discrete-Maus Hirnregionen für Gesamt-RNA Isolierung und Downstream Next-Generation Sequencing and Gene Expression Profiling

Profiling Voltage-gated Potassium Channel-mRNA Expression in nigralen Neuronen mit Einzel-Zell RT-PCR-Techniken

Einzel-Zell-Profiling der Entwicklung und Reife Netzhautneuronen

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Einzelzell-RNA-Seq von definierten Subsets von Retinal-Ganglion-Zellen

Eine In Vivo Blut - Hirn-Schranke Permeabilität Assay bei Mäusen mit Gewebekulturen beschriftet Tracer

Identifizierung von Transkription Faktor Olig2 genomische Bindungsstellen in akut PDGFRα + Zellen durch Low-Zelle Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung Analyse gereinigt