Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double <em>In Vitro</em> Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Anirban Paul; Z. Josh Huang

doi:10.3791/58690

/

Encellede RNA sekvensering av Fluorescently merket musen Neurons med manuell sortering og dobbel In Vitro transkripsjon absolutte teller sekvensering (DIVA-Seq)

JoVE Journal
Neuroscience

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Neuroscience

Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double In Vitro Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Encellede RNA sekvensering av Fluorescently merket musen Neurons med manuell sortering og dobbel In Vitro transkripsjon absolutte teller sekvensering (DIVA-Seq)

DOI:

10.3791/58690-v

•

07:49 min

•

October 26, 2018

•

Anirban Paul, Z. Josh Huang

¹Cold Spring Harbor Laboratory

Chapters

00:04Title
00:43Preparation for Dissection and Neuron Sorting
02:09Brain Sectioning and Cell Dissociation
04:15Manual Sorting of Fluorescently Labeled Mouse Neurons
05:59Results: Microdissection of GABAergic Neurons
07:24Conclusion

Summary

Automatic Translation

Denne protokollen beskriver manuell sortering fremgangsmåten for å isolere enkelt fluorescently merket neurons etterfulgt av i vitro transkripsjon-baserte mRNA forsterkning for høy-dybde encellede RNA sekvensering.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Non-Laser Capture Mikroskopi Approach for mikrodisseksjon av Discrete Mouse Brain Regions for Total RNA Isolation og nedstrøms Next-Generation Sekvensering og Gene Expression Profiling

Profiling Voltage-gated Potassium Channel mRNA Expression in Nigral Neurons using Single-cell RT-PCR Techniques

Encellet Profiling for å utvikle og modne Retinal Neurons

Real-time Imaging av aksonal Transport av Quantum Dot-merket BDNF i Primær Neuroner

Pålitelig Identifikasjon av Bo dopaminerge nevroner i midthjernen kulturer Bruke RNA sekvensering og TH-promoter-drevet EGFP Expression

Enkeltcelle RNA-Seq av definerte subsets av retinal Ganglion-celler

I Vivo blod - hjerne barrieren permeabilitet analysen mus med Fluorescently merket Tracers

Identifisere transkripsjon faktor Olig2 genomisk bindende områder i akutt renset PDGFRα + celler av lav-cellers Chromatin Immunoprecipitation sekvensering analyse