Her præsenteres en protokol til optisk udvinding og katalogisering af medfødte cellulære fluorescenssignaturer (dvs. cellulær autofluorescence) fra hver enkelt levende celle fordelt i et tredimensionelt rum. Denne metode er velegnet til at studere den medfødte fluorescenssignatur af forskellige biologiske systemer ved en enkeltcellet opløsning, herunder celler fra bakterier, svampe, gær, planter og dyr.