Denne video beskriver microinjection, en fælles metode til at skabe transgene C. elegans stammer. I eksemplet vil vi se microinjection bruges til at introducere et ribonukleoprotein (RNP) kompleks til CRISPR-baser genredigering.
Protocol
Følgende protokol er et uddrag fra Farboud et al, Enhanced Genome Editing with Cas9 Ribonucleoprotein in Diverse Cells and Organisms, J. Vis. Exp. (2018). 1. RNP Forsamling Design eksperimentet i god tid, og anskaffe alle RNA-, DNA- og proteinkomponenter på forhånd. Som et første gennemløb kan du prøve en af de positive kon…
Representative Results
Tabel 1: Positiv kontrol med foreløbige genomredigeringseksperimenter. Denne tabel viser de vigtigste oplysninger, der er nødvendige for at udføre et første gangs genomredigeringseksperiment i hver af de celler og organismer, der er beskrevet i denne protokol. Efter disse parametre vil sandsynligvis give et vellykket resultat, der kan bruges til at teste protokollen eller som en baseline til sammenlign…
Materials
Reagents/Materials
DNA oligonucleotides
Integrated DNA Technologies
–
IDT will provide custom DNA sequences, including those in Table 1
Guide RNAs
Synthego
–
Synthego will provide high-quality sgRNAs for S. pyogenes Cas9, including custom sgRNAs containing the targeting sequences included in Table 1
Purified Cas9 protein (EnGen Cas9 NLS, S. pyogenes)
New England Biosciences
M0646T
If possible, purifying Cas9 in-house or purchasing from local core facilities is a less expensive option
OP50 Escherichia coli
Caenorhabditis Genetics Center
OP-50
https://cgc.umn.edu/
Nematode Growth Media agar in petri dishes
–
–
See Stiernagle, T (ref. 59)
Standard borosilicate glass capillaries with filament: 4 in (100 mm), 1/0.58 OD/ID
World Precision Instruments
1B100F-4
Single-barrel standard borosilicate glass capillaries: 6 in (152 mm), 2/1.12 OD/ID
World Precision Instruments
1B200-6
Cover glass; 24 × 50 mm
Thermo Fisher Scientific
12-544E
Cover glass; 22 × 22 mm
Thermo Fisher Scientific
12-518-105K
Apex LE agarose
Genesee Scientific
20-102
Halocarbon oil 700
Sigma-Aldrich
H8898-100ML
pCFJ90 plasmid
Addgene
19327
Capillary tubes with filament: 4 in (1.0 mm)
World Precision Instruments
T2100F-4
Petri dishes (100 × 15 mm)
–
9" pasteur pipettes
–
Nuclease-free water
–
Equipment
MZ75 Stereomicroscope
Leica
Out-of-production. Current model is the M80 Stereomicroscope