DNA kararlı izotop problama özel substratlar kullanma yeteneğine sahip olan mikroorganizmaların aktif toplulukları tanımlamak ve karakterize etmek için bir kültür bağımsız bir yöntemdir. Ağır izotop zenginleştirilmiş substrat Asimilasyon etiketli atomların mikrobiyal biyokütle içine dahil yol açar. Yoğunluk degrade Ultrasantrifügasyon downstream moleküler analizler için işaretli DNA alır.