טיהור זיקה של חלבונים מתויגים בשילוב עם ספקטרומטריית מסה (APMS) היא שיטה רבה עצמה למיפוי השיטתי של רשתות אינטראקצית חלבון ועל חקירת הבסיס המכאני של תהליכים ביולוגיים. כאן, אנו מתארים פפטיד הליך אופטימיזציה רציפת זיקה (SPA) APMS פתח לחיידק<em> חיידקי Escherichia</em> שיכול לשמש לבודד ולאפיין קומפלקסים יציבים רב חלבון להומוגניות קרובה אפילו החל מלהעתיק מספרים נמוכים לתא.