आत्मीयता के साथ टैग मास स्पेक्ट्रोमेट्री (APMS) संयोजन में प्रोटीन की शुद्धि प्रोटीन बातचीत नेटवर्क के व्यवस्थित मानचित्रण और जैविक प्रक्रियाओं के यंत्रवत आधार की जांच के लिए एक शक्तिशाली तरीका है. यहाँ, हम एक अनुकूलित अनुक्रमिक पेप्टाइड आत्मीयता (एसपीए) APMS जीवाणु विकसित प्रक्रिया का वर्णन<em> Escherichia कोलाई</em> कि करने के लिए अलग और निकट एकरूपता भी सेल प्रति कम प्रतिलिपि संख्या से शुरू करने के लिए स्थिर बहु - प्रोटीन परिसरों विशेषताएँ इस्तेमाल किया जा सकता है.