Denne protokollen presenterer en komplett og detaljert fremgangsmåte for å søke RNA-seq, en kraftig neste generasjons DNA-sekvensering teknologi, å profilere transcriptomes i menneskelige lunge mikrovaskulære endotelceller med eller uten trombin behandling. Denne protokollen er generalizable til ulike celler eller vev som påvirkes av ulike reagenser eller sykdom stater.