A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 02:43Treatment of Cells with Thrombin, RNA Isolation, Quality Assessment and Quantification of RNA
- 03:54Library Construction and Sequencing
- 08:22Data Analysis
- 12:16Results: RNA-seq Analysis Output
- 17:16Conclusion
Detta protokoll utgör en fullständig och detaljerad procedur för att tillämpa RNA-seq, en kraftfull nästa generations DNA-sekvensering teknik, profil transcriptomes i humana pulmonära mikrovaskulära endotelceller med eller utan trombin behandling. Detta protokoll är generaliserbara till olika celler eller vävnader som påverkas av olika reagenser eller sjukdomstillstånd.
Tags
RNA-seq AnalysisTranscriptomesThrombin-treatedControlHuman Pulmonary Microvascular Endothelial CellsGene ExpressionMRNA LevelsExternal SignalsDrug TreatmentHealthy StateDiseased StateNext-generation DNA Sequencing TechnologyRNA-sequencingCatalog TranscriptsTranscriptional StructureExpressed GenesChanging Expression LevelsComplete Transcriptome ProfilingDigital Type DatumCopy Number Of TranscriptGenomic SequenceProtocolHuman Pulmonary Microvascular Endothelial Cells With Thrombin Treatment
