SILAC immunoprecipitation eksperimenter representerer et kraftig middel for å oppdage romanen protein: protein interaksjoner. Ved å la den nøyaktige relative kvantifisering av protein overflod i både kontroll-og testprøver, sanne interaksjoner kan lett skilles fra eksperimentelle forurensninger, og en lav affinitet interaksjoner konservert ved bruk av mindre strenge bufferbetingelser.