Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Anthony A. High; Haiyan Tan; Vishwajeeth R. Pagala; Mingming Niu; Ji-Hoon Cho; Xusheng Wang; Bing Bai; Junmin Peng

doi:10.3791/56474

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Isobaric लेबलिंग, व्यापक तरल क्रोमैटोग्राफी, मास स्पेक्ट्रोमेट्री, और सॉफ्टवेयर असिस्टेड ठहराव द्वारा डीप Proteome profile

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Biochemistry

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Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

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Isobaric लेबलिंग, व्यापक तरल क्रोमैटोग्राफी, मास स्पेक्ट्रोमेट्री, और सॉफ्टवेयर असिस्टेड ठहराव द्वारा डीप Proteome profile

DOI:

10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

Anthony A. High, Haiyan Tan, Vishwajeeth R. Pagala, Mingming Niu³, Ji-Hoon Cho, Xusheng Wang, Bing Bai, Junmin Peng²

¹St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, ²Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, ³Heilongjiang University of Chinese Medicine

Chapters

00:05Title
01:00Preparation of Cells/Tissues
01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
04:45TMT Labeling of Peptides
05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
08:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

हम सही isobaric लेबलिंग, व्यापक भिन्नीकरण, bioinformatics उपकरण, और एक उच्च संकल्प जन स्पेक्ट्रोमीटर के लिए इंटरफेस के साथ संयोजन में गुणवत्ता नियंत्रण कदम के साथ प्रोटीन quantitate करने के लिए एक प्रोटोकॉल पेश करते हैं ।

Isobaric लेबलिंग, व्यापक तरल क्रोमैटोग्राफी, मास स्पेक्ट्रोमेट्री, और सॉफ्टवेयर असिस्टेड ठहराव द्वारा डीप Proteome profile

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