Komplexiteten i vivo system gör det svårt att skilja mellan aktivering och hämning av Notch receptor av trans- och cis-ligander, respektive. Här presenterar vi ett protokoll baserat på in vitro- cell-aggregering analyser för kvalitativa och semikvantitativt utvärdering av bindningen av Drosophila Notch till trans-ligander vs cis-ligander.