Journal
/
/
Kartlegging av strukturfunksjonsrelasjoner av uordnede onkogene transkripsjonsfaktorer ved hjelp av transkripsjonsanalyse
JoVE Journal
Cancer Research
This content is Free Access.
JoVE Journal Cancer Research
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
DOI:

09:58 min

June 27, 2020

, , , , ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Automatic Translation

Iboende uordnede domener er viktige for onkogen fusjonstranskripsjonsfaktorfunksjon. For å terapeutisk målrette disse proteinene, er det nødvendig med en mer detaljert forståelse av reguleringsmekanismene som brukes av disse domenene. Her bruker vi transkripsjon for å kartlegge viktige strukturelle egenskaper ved det iboende uordnede EWS-domenet i Ewing sarkom.

Related Videos

Read Article