Abstract
bağırsaklar - Vücutta herhangi bir organın bağışıklık hücrelerinin en fazla sayıda içerirler - sürekli yabancı antijenleri, mikrobik ve diyet hem de maruz kalmaktadır. bağırsak sistemik hastalıkların bir dizi için kritik olan bu lümen antijenler immün yanıtı ve bağışıklık hücrelerinin eğitimin şekillenmesine yardımcı olduğunu giderek artan bir anlayış göz önüne alındığında, bağırsak bağışıklık sistemini karakterize ilgi var artmıştır. Bununla birlikte, bir çok yayınlanmış protokoller zor, zaman alıcıdır. Biz, hızlı, tekrarlanabilir ve zahmetli Percoll geçişlerini gerektirmez ince bağırsak lamina propria, intraepitelyal tabaka ve Peyer yamaları lenfositlerin izolasyonu için burada basitleştirilmiş bir protokol mevcut. Protokol, ince bağırsakta üzerine odaklanmış olmakla beraber, bu da kolon analizi için de uygundur. Ayrıca, biz belirli bir bilimsel ques bağlı olarak ek optimizasyon gerekebilir bazı yönlerini vurgulamakyon. Bu yaklaşım daha sonra, akış sitometrik analizinde ve özellikleri alternatif yollarla kullanılabilir uygulanabilir lenfositler, çok sayıda ayrı olarak elde edilir.
Introduction
İnce bağırsağın temel görevi, genellikle besinlerin 1 sindirim ve emilim olarak kabul edilir. Bu metabolik fonksiyon açıkça gerekli iken, ince bağırsak lümeninin 2 içinde bulunan çevresel antijenlere sürekli baraj konağı korunmasında eşit derecede önemli bir role sahiptir. Bağırsak dış dünyayı ayıran (örn., Lümen antijenler) Sadece tek bir hücre tabakası kalınlığında bir epitel tabakası ile konağın iç ortamdan. Bu şekilde, ince bağırsak, bağışıklık sistemi, işgalci patojenlere karşı güçlü bir yanıtın monte ederken, minimal mukoza girmek için diyet ve ortakçı mikroplardan yabancı antijenleri sağlayan, herhangi bir halinde, bir bağışıklık tepkisi reaktivite için eşik dengeleme üstün görevi, öteki "zararlı" antijenler. Bu antijenlere karşı aşırı ya da uygunsuz immün yanıtlar (patolojik hastalığa yol açabilir, örneğin., Inflamasyonedici bağırsak hastalığı, tip I diyabet, çok merkezli skleroz) ve 3-6 kaçınılmalıdır.
Genel olarak, mide-bağırsak yolu, tüm antikor salgılayan hücreler 7% 70 üzerinde içeren, vücudun en büyük immün organı temsil ettiği düşünülmektedir. Lamina propriya (LP), intraepitelyal tabaka ve Peyer yamaları (PPS) - - ince bağırsak bağışıklık sistemi 3 ana bölmeden oluşur, her lenfosit 2 ayırt edici bir grubu içerir. LP lenfositleri (LPLs) ~% 20 B hücreleri ile esas TCRαβ + T hücreleridir; intraepitelyal lenfositler (IELS) TCRαβ + T hücreleri daha TCRγδ + T hücreleri çok az sayıda B hücrelerini içeren; ve ince bağırsak duvarında gömülü ikincil lenfoid organlar PPs, ~% 80 B hücrelerini içerirler. Bu anatomik bölgelerin her biraz farklı fonksiyonları ve ontolojik üsleri olmasına rağmen, onlar işlev aharmonized moda patojenik hakaretlere gelen ev sahibi korumak için.
Ayrıca, Mikrobiyota özel mikroplar ve özellikle hücre soylarının 8,9 ontogeny arasındaki soydaş ilişkinin tanıma artan bağırsak bağışıklık sisteminin gelişimi için kritik bir belirleyicisi olduğunu büyüyen takdir var. Ayrıca, bağırsak bağışıklık sisteminin eğitim anatomik uzak bölgelerde bağışıklık tepkilerini etkiler göz önüne alındığında (örneğin., Artrit, multipl skleroz, pnömoni), daha önce 10 tanıdı daha bağırsak bağışıklık sisteminin gelişmesi daha hastalık süreçleri ile ilgili olduğu açıkça ortaya çıktı -12. Bu nedenle, kantitatif bağırsak bağışıklık sistemini değerlendirirken ilgi şimdi konak-ortakçı etkileşimleri ve birçok sistemik hastalığın patogenezi de içerecek şekilde konak-patojen etkileşimleri aşmıştır.
mevcut yöntemlerin değişkenliği göz önüne alındığındabağırsak lenfosit izolasyonu gerekli zamanı dengeleme giderek kritik iken verimi, canlılığı ve tutarlılık için optimize edilmiş bir yöntem. Percoll geçişlerini içeren protokoller, zaman ve emek yoğun ve insan hatası potansiyel olarak daha yatkındır değişken verim giden ve 13 canlılığı. Burada, 3 ince bağırsak immün bölmelerden lenfositlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu için optimize edilmiş bir protokol sağlar. Buna ek olarak, mukozal bağışıklık sistemi mikrop kaynaklı değişikler verilen artan bir ilgi, bu değişikliklerin kantitatif bağırsak bağışıklık sistemini nasıl etkilediği değerlendirmek için fareler arasında mikroorganizmaların yatay aktarım sağlamak için kullanılabilir adımları içerir.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
Tüm çalışmalar Laboratuar Hayvanları Bilimi için Amerikan Derneği (AALAS) tarafından belirlenen veteriner standartlarını karşılayan Harvard Tıp Okulu'nda Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) göre sıkı inceleme ve kuralları uyarınca yapılmıştır.
Co-konut yoluyla Bakterilerin 1. Yatay İletim (İsteğe bağlı)
- yiyecek ve her ikisi de otoklavlanmış edilmiş su kullanarak, steril tek kullanımlık kafesleri montaj sırasında (gnotobiyotik fareler kullanılarak özellikle) eksojen kontaminasyonu en aza indirmek için, aseptik teknik uygulama.
- Kullanım kulak yumruklar veya etiketleri tek tek farklı microbiotas liman ve aynı kafeste onlara ev 6 haftalık C57BL / 6 fareler işaretlemek için. fareler coprophagic ve kafes yerden fekal pelet yemek göz önüne alındığında, mikroplar doğal fareler arasında yatay iletilecektir.
- ≥1 hafta Co-ev fareler analizden önce mikrobiyal transferi ve immünolojik değişim için zaman tanımak için. Küçük bağırsak intraepitelyal Katman ve lamina propria bir Tek Hücre Süspansiyon 2. Hazırlık
- Çözümler hazırlanması
- (Ince bağırsak başına) Ekstraksiyonu hazırlanması: 30 ml RPMI + 93 ul% 5 ditiyotreitol (DTT) (w / v) + 60 ul 0.5 M EDTA + 500 ul cenin sığır serumu (FBS). Kullanmadan önce hemen DTT ekleyin.
- 25 ml RPMI + 12.5 mg dispase + 37.5 mg kollajenaz II + 300 ul FBS: (ince bağırsağın başına) sindirim ortamı hazırlayın. Kullanmadan önce hemen dispase ve kollajenaz ekleyin.
- 37 ° C, 37 ° C, ön ısıtılması çözeltiler gerçekleştirilen tüm inkubasyon için.
- Servikal dislokasyon tarafından takip CO 2 boğulma fare Euthanize.
- aşağı fare dorsal yüzü koyun ve% 70 etanol ile karın püskürtün. sırayla fro ventral orta hat boyunca cilt ve sonra periton fasya keserek bir laparotomi gerçekleştirmek için makas kullanınböylece periton boşluğuna açığa kılıç şeklinde sürecine pubis eklemi m.
- pilor sfinkter bölücü ile mideden ince bağırsağa ayırmak için makas kullanın. Yavaşça mezenterik yağ uzak alay, periton ince bağırsak kaldırın.
- Tamamen ince bağırsak kaldırmak için, ileo-çekal kavşakta ikinci bir kesim yapmak. Soğuk izole edilmiş ince bağırsağa yerleştirin (yani., 4 ° C),% 10 FBS içeren RPMI hücre canlılığı üst düzeye çıkarır.
- Yavaşça kavisli bir forseps kullanarak yağ büyük parçalar çıkarın. yağ çıkarmak isterken bağırsak dokusu kendisini yırtılmasını önlemek için dikkatli kullanın.
- bir şırınga yapıştırılmış bir 18 G besleme iğne kullanılarak soğuk PBS 20 ml - 15 ile bağırsak içeriği, hafifçe yıkayın bağırsakları kaldırmak için.
- PPS tüketim için makas kullanın ve% 5 FBS içeren soğuk RPMI içine koyun. PPs ince bağırsak antimezenterik tarafında bulunur ve bir çok-lobüle beyaz görünürkitle. 12 PPS - Belirli zorlanma bağlı olarak, bir fare, genellikle 8 sahiptir.
- 4 inçlik segmentlerine - 3 içine ince bağırsak kesti.
- uzak dokudan yağ kızdırmak için sıkıcı bir neşter kullanılarak, RPMI ile nemlendirilmiş bir kağıt havlu üzerine her ince bağırsak segmenti yuvarlayarak kalan yağ çıkarmak.
- kavisli bir forseps ile bağırsak segmentleri kanüle ve doku distal ucunu tutarak dışarı içinde doku çevirin. Sonra yavaşça doku ters olan sonuçlanan (proksimal ucunda başlar) kavisli bir forseps doku segmenti çıkarmak için düz forseps bir çift kullanın.
- 30 emme ml ortam ve bir karıştırma çubuğu ihtiva eden bir kap içinde, doku bölümleri yerleştirin. fincan kapağı elde edin ve 37 ° C'de 15 dakika boyunca 500 rpm'de karıştırıldı; karıştırma dinç ama çalkantılı olmamalıdır.
- kuluçkadan sonra bulutlu görünmelidir epitel içeren süpernatant, doku parçaları ayırmak için çelik süzgeç kullanın. Bu yüzer madde i içerir2.23 - adımda 2.18 numune süzme işlem yolu ile, arzu edildiği takdirde daha da analiz edilebilir ntraepithelial lenfositler.
- El ile artık çıkarma medya yıkayacak RPMI doku parçaları çalkalayın.
- kuru bir kağıt havlu üzerine doku yerleştirin ve ekstraksiyon ortamı tarafından serbest değildi bakiye mukus çıkarılmasını kolaylaştırmak için son birkaç kez sona çevirin.
- Sindirim ortamının 600 ul, 1.5 ml bir tüp içinde doku parçaları yerleştirin.
- parçalar artık makas sopa ve çözüm homojen görünene kadar doku kıyma için makas kullanın. Bu adım, doku tam enzimatik sindirim sağlamak için çok önemlidir.
- sindirim medya 25 ml içeren bir bardağa kıyılmış ince bağırsak ekleyin. 37 ° C'de 30 dakika boyunca 500 rpm'de karıştırılır. Yarım sindirim yoluyla (yani., 15 dk), pipetlemeyin yukarı ve serolojik pipet ile aşağı dokusunun herhangi büyük boyutta break up yardımcı olur.
- Filtre Sindirilmiş doku (veya epithadım 2.12 Elial tabaka halinde 50 ml'lik bir tüp içine 100 mikron hücre süzgecinden işleme IELS). % 10 FBS ihtiva eden RPMI 20 ml süzgeç durulayın.
- 4 ° C'de 10 dakika boyunca 500 x g'de filtre solüsyonu santrifüjleyin.
- Dikkatle% 10 FBS ihtiva eden RPMI 1 ml süpernatan ve tekrar süspansiyon pelet süzün.
- Filtre 50 ml'lik bir tüp içine, 40 mikron hücre süzgecinden hücreler yeniden süspansiyon haline getirildi. % 10 FBS ihtiva eden RPMI 20 ml süzgeç durulayın.
- Santrifüj, 4 ° C'de 10 dakika boyunca 500 xg'de çözelti filtre edilmiştir.
- Dikkatle% 2 FBS içeren RPMI 1 ml süpernatan, ve tekrar süspansiyon pelet süzün.
- Transferi 25 sindirim medya ml ve bir karıştırma çubuğu ile bir fincan PPS eksize. Güvenli kapağı ve 37 ° C'de 10 dakika boyunca 500 rpm'de döndürün.
- Filtre 50 ml'lik bir tüp içine 40 mikron hücre süzgecinden PPS sindirilmiş. herhangi bir yığınının Rema Eğeriçinde, bir 1 ml şırınga pistonu düz ucunu kullanarak süzgeç aracılığıyla basın.
- % 10 FBS ihtiva eden RPMI 10 ml süzgeç durulayın.
- Santrifüj, 4 ° C'de 10 dakika boyunca 500 xg'de çözelti filtre edilmiştir.
- Dikkatle% 2 FBS içeren RPMI 1 ml süpernatan, ve tekrar süspansiyon pelet süzün.
- Hücre kısım uygun hacmi (örneğin., LPLs 200 ul) 96-çukurlu yuvarlak tabanlı plaka.
- 4 ° C'de 5 dakika boyunca 500 x g'de santrifüjleyin. plakayı ters çevirerek süpernatant süzün.
- RPMI% 2 FBS içeren 90 ul içinde süspanse hücreleri ve bir 1: anti-CD16 / 32 (Fc Block) 100 dilüsyon. 4 ° C'de 10 dakika süreyle inkübe edilir.
- 10 ul PBS ekleyin. 4 ° C'de 5 dakika boyunca 500 x g'de santrifüjleyin. plakayı ters çevirerek süpernatant süzün.
- 250 ul PBS içinde süspanse edin hücreleri. 4 ° C'de 5 dakika boyunca 500 x g'de santrifüjleyin. tarafından decant süpernatantplakayı tersini.
- üreticinin protokolünü takip ederek, eğer istenirse canlılığı boya ile (isteğe bağlı) boyama hücreleri.
- 100 ul% 1 formalin içinde süspanse hücreler düzeltmek için. 4 ° C'de karanlıkta 1 saat süreyle inkübe edin.
- 200 ul PBS ekleyin. 4 ° C'de 5 dakika boyunca 500 x g'de santrifüjleyin. plakayı ters çevirerek süpernatant süzün.
- 250 ul PBS içinde süspanse edin hücreleri. 4 ° C'de 5 dakika boyunca 500 x g'de santrifüjleyin. plakayı ters çevirerek süpernatant süzün.
- 200 ul PBS içinde süspanse edin hücreleri. bir akış sitometresinin kullanarak hücrelerin analiz edin.
Peyer yamaları tek bir hücre süspansiyonu 3. hazırlanması
Akım Sitometrisi 4. Yüzey Boyama
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Splenositler (Şekil 1A ve 1B) halinde ileri içindeki ve yan saçılma özelliklere sahip farklı bir hücreler popülasyonu elde gereken ince bağırsak lenfositlerin tekli hücre süspansiyonları, akış sitometrik analizi. Doku izolasyon ilk aşamalarında, 4 ° C de muhafaza değilse lenfositleri daha düşük bir ileri dağılım olan ve diğer epitel ve ölü hücrelerden ayırmak için daha zor olan lenfosit popülasyonu ile sonuçlanan, kalıp başlayabilir (Şekil 1C) . Ince bağırsak dokusu tamamen mezenterik yağ temizliği değil Ayrıca, eğer, lenfositler (Şekil 1D) tam bir kayıp hemen hemen yoktur. Bu özellikler hızla çalışan nasıl örnek kalitesini sağlamak için gerekli olan (mezenterik yağ hatta küçük miktarlarda kaldırarak, yani.) (Yani., Doku ısınmak için izin verilmez) ve detaylara dikkat göstermektedir. Typically biz ~ ince bağırsak LPLs (Şekil 1 E)% 80 canlılığı elde.
Şekil 2A Mikrobiyota bileşimi büyük ölçüde belirli bir hücre popülasyonlarının sayıları nasıl etkilediğini gösterir. Daha önce gösterildiği gibi, herhangi bir mikroorganizma tamamen yoksun olan mikropsuz (GF) fareler, spesifik patojensiz (SPF) fareler ile karşılaştırıldığında belirgin bir şekilde olgunlaşmamış küçük bağırsak bağışıklık sistemine sahip ve GF farelerin kolonizasyonu ince bağırsak, bağışıklık sisteminin 14 yeniden normal bir fare Mikrobiyota (MMB) sonuçları. Buna karşılık, gnotobiyotik fareler normal bir insan Mikrobiyota (Hmb) barındıran - ve bu benzer bir sayı ve MMB fareler gibi fekal bakteri çeşitliliği var - GF fareler 14 farksız olan bir ince bağırsak bağışıklık sistemi var.
Dan yararlanmakFarelerin coprophagic doğa, eş-konut fareler bir araya fareler arasında organizmaların yatay iletimine izin veren için basit, ama güçlü bir yöntem temsil eder. Bu yaklaşım bir Mikrobiyota sonuçlanan değişim ince bağırsak bağışıklık sistemini etkileyip etkilemediğini test etmenizi sağlar. Bir örnek olarak, SI LP (Şekil 2B) 14, CD3 + CD8 + T hücrelerinin sayısı normalleşmesine yolaçtı, 4 hafta boyunca MMB farelerle co-gövde HMB fareler gösterdi. Farenin birbirine eş yuva üstesinden varyasyonlar - Bu sonuç, Şekil 2A'da görülen MMB ve HMB fareleri arasındaki fark, bu fareler arasında Mikrobiyota değişimlerine bağlı olduğunu onaylar.
. D. D - Şekil 1. Bağırsak Lenfositler FSC ve splenositler, A Benzer DGM Özellikleri sahipoptimal hazırlanan splenositlerin (A) ve ince bağırsak lamina propria (SI LP) hücreleri (- D B) SSC ve FSC gösteren ot araziler. B. SI LP örneği tarif edilen protokole göre hazırlandı. C. bağırsak doku kasıtlı SI LP hücreleri daha düşük bir FSC sahip başlar göstermek ısınmaya bırakılmıştır. D. mezenterik yağ bir fark SI LP lenfosit nüfus kaybına neden tek hücrelerin hazırlanması öncesinde ince bağırsak kapalı temizlenmiş değildi. E. paneli B tasvir örnek sabitlenebilir canlılığı boya ile adım 4.7 lekeli (örn., EFluor 780) üreticinin talimatlarına göre. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil 2. Küçük intest ve Mikrobiyota Etkileri Olgunlaşmainal Bağışıklık Sistemi. A. CD3 +, CD8 + T hücreleri, SPF, MMB, HMB ve GF farelerin SI LP numaralanmıştır. B. HMB farenin eş barındırılmıştır önceden SI lp, CD3 + CD8 + T hücreleri numaralandırma 4 hafta içinde MMB fareler. co-yer değil MMB ve HMB farenin karşılaştırma amacıyla analiz edildi. Her veri noktası, bağımsız bir fare temsil eder ve Dikey çubuklar, ortalamayı yansıtır. NS, anlamlı değil; * P <0.05; ** P <0.01; *** P <0.001. Şekiller yeniden-ile olan izni-başvuruya 14, B. hafif değişiklik ile bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Biz izolasyonu için bir protokol mevcut ve PPS'de LPLs, IELS ve lenfositler de dahil olmak üzere ince bağırsak lenfosit, sitometrik karakterizasyonu akar. Mikrobiyota değişiklikler ince bağırsak bağışıklık sistemini nasıl etkilediğini değerlendirmek ilgilenenler için, detay farklı microbiotas barındıran fareler arasında organizmaların yatay iletim dahil basit adımlar. Bu protokol, ince bağırsakta odaklanır rağmen, prosedür tek fark hiçbir PPs kaldırmak için vardır (kolon yamalar mevcut olmasına rağmen, bunlar fena halde genelde görünmez) varlık ile, kalın bağırsağın analizi için aynıdır.
ince bağırsak dokusundan lenfositlerin optimum izolasyon ulaşmada birkaç temel adım vardır. adipoz dokudan titiz kaldırma lenfosit canlılığı ve optimal verim sağlamak için kesinlikle çok kritiktir. Buna ek olarak, DTT ekstre kullanılan önemli bir mukolitik birEpitel hücrelerinin. istikrarsız doğası göz önüne alındığında, yeniden dondurma kullanılmayan hacim ≤-20 ° C de% 5 çözeltisi tek kullanımlık alikotları depolamak olup öneriyoruz. EDTA epitel hücreleri 15 çıkarılmasına yardımcı olmak için ekstraksiyon ortamı olarak kullanılır, ancak varlığı - hem de aşırı FBS ya da mukus - sindirim süreci sırasında kolajenazları inhibe edebilir. Kolajenaz kullanılan konsantrasyonu farklı olarak yüzey işaretleyici ifade ve hücre canlılığı 13,16,17 etkilediği gösterilmiştir. Ayrıca, ilgi konusu yüzey işaretleyici bağlı olarak, kolajenaz farklı bir formülasyon (ör., Kolajenaz tip I, II, VI ya da VIII) 13,17 optimaldir olabilir. Bazı ampirik optimizasyonu partiden partiye değişiklik, belirli bir çok ve kolajenaz göreli aktivite seviyesine bağlı olarak, belirli bir deney soruya bağlı olarak gerekli olabilir. Ayrıca, ek optimizasyon Belir bağlı olarak gerekli olabiliric zorlanma ve fare yaşı kullanılır. Örneğin, burada listelenen kez ~ 6 hafta eski C57BL / 6 fare için optimize edilmiştir; A ~ 8 haftalık İsviçre Webster fare için, sindirim süresi 40 dakikaya artırılabilir.
Özetle, biz ince bağırsak lamina propria lenfositler, intraepitelyal tabaka ve PPS izolasyonu için ayrıntılı bir protokol hazırladık. Bir kez hakim bir makul 4 fareler işlemek ve ~ 4 saat boyanma hazır tek hücre süspansiyonları olabilir. Biz akım sitometri karakterizasyonu için bu hücrelerin hemen boyama tarif olsa da, bir alternatif olarak, sitokin üretimini değerlendirmek diğer hücre tipleri ile in vitro etkileşimleri bakmak için transkripsiyon ve / veya proteomik analizler, ya da kültür hücreleri hücreleri sıralamak için bu hücreleri uyarabilir. Bu lenfosit popülasyonu odaklanmış Dahası, bu protokol, aynı zamanda miyeloid hücreleri incelemek için kullanılabilir. Tek ce izole etmek, birlikte bu aerodinamik yaklaşım benimsemiştirçeşitli bağırsak bölmelerden ll nüfusları bir sorguya sağlar hem de çeşitli faktörler (örneğin., Mikrobiyota, diyet antijenler) bu hücreler ekstra-bağırsak hastalıkları ilgili olabilir ne de bağırsak bağışıklık sisteminin ontogenezini etkilemek ve nasıl.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Sterile Gloves | Kimberly-Clark | 555092 | |
| sterile mouse cage | Innovive | MS2-AD | contains lid, cage bottom, and alpha-dri bedding |
| Metal feeder | Innovive | M-FEED | |
| Water bottle | Innovive | M-WB-300 | |
| Card holder | Innovive | CRD-HLD-H | |
| Autoclavable rodent chow (NIH-31M) | Zeigler | 4131207530 | |
| RPMI medium 1640 | Gibco | 11875-119 | |
| Dithiothreitol (DTT) | Sigma | D5545-5G | |
| 0.5 M EDTA (pH 8.0) | Ambion | AM9262 | |
| Fetal Bovine Serum (FBS) | GemBio | 100-510 | |
| Dispase II | Invitrogen | 17105-041 | the concentration in the protocol is based on an activity level of 1.878 U/mg |
| Collagenase, type II | Invitrogen | 17101-015 | the concentration in the protocol is based on an activity level of 245 U/mg |
| Dissecting scissors | Roboz | RS-5882 | |
| Feeding needle (18 G, 2" length) | Roboz | FN-7905 | |
| 10 ml Syringe | BD | 305482 | |
| PBS | Gibco | 14190-250 | |
| Disposable Scalpel (15 blade) | Miltex | 4-415 | |
| Curved forceps | Roboz | RS-5211 | |
| Straight forceps | Roboz | RS-5132 | |
| Multi-purpose cups, 120 ml | VWR | 89009-662 | |
| Stir bar | VWR | 58949-062 | |
| Multi-position stir plate, 9-position | VWR | 12621-048 | |
| Stainless steel conical strainer, 3 inch | RSVP | ||
| 1.5 ml Tube | Eppendorf | 0030 125.150 | |
| 100 μm Cell strainer | Falcon | 08-771-19 | |
| 40 μm Cell strainer | Falcon | 08-771-1 | |
| 50 ml Conical tube | Falcon | 352098 | |
| 1 ml Syringe | BD | 309659 | |
| 96-well Plate, round-bottom | Corning | 3799 | |
| Anti-mouse CD16/32 (Fc block) | Biolegend | 101320 | |
| (Optional) Fixable viability dye eFluor 780 | eBiosciences | 65-0865-18 | |
| 10% Formalin, neutral buffered | Thermo Scientific | 5725 |
References
- Cummings, D. E., Overduin, J.
- Mowat, A. M., Agace, W. W. Regional specialization within the intestinal immune system. Nat Rev Immunol. 14 (10), 667-685 (2014).
- Round, J. L., Mazmanian, S. K. The gut microbiota shapes intestinal immune responses during health and disease. Nat Rev Immunol. 9 (5), 313-323 (2009).
- Sartor, R. B. Microbial influences in inflammatory bowel diseases. Gastroenterology. 134 (2), 577-594 (2008).
- Tlaskalova-Hogenova, H., et al. Commensal bacteria (normal microflora), mucosal immunity and chronic inflammatory and autoimmune diseases. Immunol Lett. 93 (2-3), 97-108 (2004).
- Wen, L., et al. Innate immunity and intestinal microbiota in the development of Type 1 diabetes. Nature. 455 (7216), 1109-1113 (2008).
- Pabst, R., Russell, M. W., Brandtzaeg, P. Tissue distribution of lymphocytes and plasma cells and the role of the gut. Trends Immunol. 29 (5), author reply 209-210 206-208 (2008).
- Surana, N. K., Kasper, D. L. The yin yang of bacterial polysaccharides: lessons learned from B. fragilis PSA. Immunol Rev. 245 (1), 13-26 (2012).
- Surana, N. K., Kasper, D. L. Deciphering the tete-a-tete between the microbiota and the immune system. J Clin Invest. 124 (10), 4197-4203 (2014).
- Gauguet, S., et al. Intestinal microbiota of mice influences resistance to Staphylococcus aureus pneumonia. Infect Immun. , (2015).
- Ochoa-Reparaz, J., et al. A polysaccharide from the human commensal Bacteroides fragilis protects against CNS demyelinating disease. Mucosal Immunol. 3 (5), 487-495 (2010).
- Wu, H. J., et al. Gut-residing segmented filamentous bacteria drive autoimmune arthritis via T helper 17 cells. Immunity. 32 (6), 815-827 (2010).
- Goodyear, A. W., Kumar, A., Dow, S., Ryan, E. P. Optimization of murine small intestine leukocyte isolation for global immune phenotype analysis. J Immunol Methods. 405, 97-108 (2014).
- Chung, H., et al. Gut immune maturation depends on colonization with a host-specific microbiota. Cell. 149 (7), 1578-1593 (2012).
- Resendiz-Albor, A. A., Esquivel, R., Lopez-Revilla, R., Verdin, L., Moreno-Fierros, L. Striking phenotypic and functional differences in lamina propria lymphocytes from the large and small intestine of mice. Life Sci. 76 (24), 2783-2803 (2005).
- Carrasco, A., et al. Comparison of lymphocyte isolation methods for endoscopic biopsy specimens from the colonic mucosa. J Immunol Methods. 389 (1-2), 29-37 (2013).
- Van Damme, N., et al. Chemical agents and enzymes used for the extraction of gut lymphocytes influence flow cytometric detection of T cell surface markers. J Immunol Methods. 236 (1-2), 27-35 (2000).
