Vi presenterer en protokoll for funksjonell vurdering av omfattende single-site metning mutagenese biblioteker av proteiner utnytte high-throughput sekvensering. Viktigere, bruker denne tilnærmingen ortogonale primerpar å multiplekse bibliotek konstruksjon og sekvensering. Representative resultater ved hjelp av TEM-1 β-laktamase valgt på en klinisk relevant dosering av ampicillin er gitt.