Lipiddroppar är viktiga organeller för replikation av flera patogener, däribland hepatit C-virus (HCV). Vi beskriver ett förfarande för att isolera lipiddroppar för kvantitativ masspektrometri av associerade proteiner; den kan användas under en mängd olika tillstånd, såsom virusinfektion, miljöstress, eller läkemedelsbehandling.