הגנום מאורגן במרחב הגרעיני למבנים שונים שניתן לגלות באמצעות טכנולוגיות לכידת קונפורמציה כרומוזומית. שיטת Hi-C בגרעין מספקת אוסף רחב של אינטראקציות כרומטין בקווי תאים של Drosophila, אשר מייצר מפות מגע שניתן לחקור ברזולוציית מגה-בסיס ברמת שבר ההגבלה.