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Chapters
- 00:05Introduction
- 01:13Schneiders Line 2 Plus (S2R+) Drosophila Cell Fixation
- 02:02Lysis
- 03:18Enzymatic Digestion, DNA End Biotinylation, and Ligation
- 04:37Crosslink Reversal and DNA Purification
- 05:33Hi-C Template Quality Evaluation
- 06:26Biotin Removal/End Repair and Size Selection
- 07:49Biotin Pulldown/A-Tailing/Adapter Ligation
- 09:33Results: Representative In-Nucleus Hi-C Analysis
- 11:17Conclusion
Il genoma è organizzato nello spazio nucleare in diverse strutture che possono essere rivelate attraverso tecnologie di cattura della conformazione cromosomica. Il metodo Hi-C in-nucleus fornisce una raccolta a livello di genoma di interazioni cromatiniche nelle linee cellulari di Drosophila, che genera mappe di contatto che possono essere esplorate a risoluzione megabase a livello di frammento di restrizione.
