Summary

Semi-automatiske Imaging af Vævsspecifik Fluorescens i zebrafisk embryoner

Published: May 17, 2014
doi:
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Summary

Beskrevet her er en protokol til halvautomatisk billeddannelse af væv-specifik fluorescens i zebrafisk embryoner.

Abstract

Zebrafisk embryoner er et kraftfuldt værktøj til storstilet screening af små molekyler. Transgene zebrafisk, der udtrykker fluorescerende reporter proteiner der ofte bruges til at identificere kemikalier, der modulerer genekspression. Kemiske skærme, assay fluorescens i levende zebrafisk ofte afhængige dyrt, specialudstyr til højt indhold screening. Vi beskriver en procedure ved hjælp af en standard epifluorescensmikroskop med en motoriseret scene til automatisk billed zebrafisk embryoner og opdage vævs-specifik fluorescens. Brug transgene zebrafisk der rapporterer østrogen receptor aktivitet via udtryk af GFP, har vi udviklet en semi-automatiseret procedure for at screene for østrogen-receptor-ligander, der aktiverer reporter i et væv-specifik måde. I denne video beskrives procedurer for gruppering zebrafisk embryoer ved 24-48 timer efter befrugtning (HPF) i en 96-brønds plade og tilsætning af små molekyler, der binder østrogenreceptorer. Ved 72-96 HPF, billeder af hver brønd frahele pladen automatisk opsamles og undersøges manuelt for vævs-specifik fluorescens. Denne protokol demonstrerer evnen til at opdage østrogener, der aktiverer receptorer i hjerteklapper, men ikke i leveren.

Introduction

Transgen zebrafisk er blevet udviklet, som giver mulighed for direkte visualisering af aktivitet i signalveje, såsom fibroblastvækstfaktorer 1 retinsyre 2 og østrogener 3, i levende embryoer. Sådanne værktøjer muliggør screening for kemikalier, der forstyrrer signalveje (analyseret som ændringer i fluorescensintensitet) eller kemikalier, som modulerer signalering en vævsspecifik måde (ændring i fluorescens lokalisering) 4.. Automatiseret billedoptagelse øger throughput af kemiske skærme dramatisk 5,6. Skærme, der automatisk assay fluorescens i levende zebrafisk ofte afhængige af dyre, specialiseret udstyr. Såkaldte højt indhold screening giver fordelen ved høj opløsning, kvantitativ billeddannelse men på bekostning af hjælp af specialiserede pladelæsere udstyret til konfokal mikroskopi 7,8. Målet med denne metode er at automatisk assay vævsspecifik fluorescens i zebrafisk embryoneri en 96-brønds plade ved anvendelse af en standard epifluorescensmikroskop. Tissue-specifik fluorescens kan skelnes ved hjælp af denne teknik, og kan være en fornuftig tilgang til laboratorier, der mangler adgang til specialiserede pladelæsere eller high-content screening udstyr.

I denne protokol, vi bruger automatiseret billeddannelse til at opdage vævsspecifik østrogen receptor (ER)-agonister i levende zebrafisk ved 3 dage efter befrugtning (DPF). De transgene linje Tg (5xERE: GFP) c262/c262 indeholder 5 tandem østrogenresponselementer element DNA-sekvenser (EBS) opstrøms for grønt fluorescerende protein (GFP) 3. I fravær af ligand, ERS normalt inaktive. Ligandbinding udløser en konformationsændring, så receptorer til at binde ERE DNA og således regulere transkription 9. 5xERE: GFP fisk kan anvendes til screening af kemiske biblioteker for ER-modulatorer og kan anvendes til at screene miljømæssige vandprøver til østrogene stoffer.

Protocol

BEMÆRK: Denne protokol blev godkendt af University of Alabama i Birmingham Institutional Animal Care og brug Udvalg. 1.. Zebrafisk Forædling og Egg Samlinger Tre dage før du begynder kemiske eksponeringer, samle avl tanke med skillevægge til separate hanner og hunner. Fyld hver tank halvvejs med akvakultursystemet vand. Ved hjælp af et net, overføre Tg (5xERE: GFP) c262/c262 fisk til avl tanke, at placere 2 hanner og 3 hunner i hver tank adskilt af en skillevæg. Sæt låg på hver tank og mærke med dato og stammer skal krydses. Den følgende morgen, fjerne alle hindringer og vippe forbløffer at skabe et lavvandet område i den ene ende af akvariet. Tillad zebrafisk til at parre sig, indsamle embryoner ved 10 min intervaller for at sikre præcis udviklingsmæssige iscenesættelse. Rene æg ved at skylle gennem en tesi hjælp E3B medium og skyl forsigtigt embryoner i petriskåle. Retur voksne fisk til permanenttanke. Ved hjælp af et dissektionsmikroskop, sortere, tælle, og fjern eventuelle ubefrugtede, unormal eller beskadigede embryoner. Placer embryoner i petriskåle i E3B medium og hus ved 28,5 ° C med en 14:10 lys: mørke cyklus. Embryo tæthed kan påvirke udvikling. Placer ikke mere end 100 embryoner i en 100 x 35 mm skål og ikke mere end 50 embryoner i en 60 x 15 mm skål. Ved 24 HPF, udskifte medier med E3B indeholdende 200 uM 1-phenyl 2-thiourinstof (PTU). PTU forebygger pigment dannelse og holder zebrafisk embryoner og larver gennemskuelig for forbedret image klarhed. ADVARSEL: koncentreret PTU bestand er farligt; bære handsker, når de foretager E3B + PTU løsning. Ved 1 dag efter befrugtning (DPF), manuelt fjerne chorion fra hvert foster ved hjælp af fine tænger. Chorion synes ikke at påvirke penetration af østrogener, men fjernelse forbedrer billedets klarhed. Der er ingen grund til at fjerne chorions fra medierne. BEMÆRK: Som alternativ til manuel dechorionation, partier af embryoner kan chemisk dechorionated anvendelse af 1 mg / ml pronase behandling, som tidligere beskrevet 11. 2.. Kemisk behandling af embryoner Dagen før behandlingen, forberede stamopløsninger af hvert kemikalie ved 1.000-fold koncentration i DMSO (eller passende opløsningsmiddel). For eksempel, at udsætte embryoner til 10 uM bisphenol A (BPA) fremstilles en 10 mM BPA stamopløsning i 100% DMSO. Dette sikrer ensartet DMSO-koncentration i hver behandlingsgruppe og tillader en ikke-toksisk 1:1.000 fortynding af DMSO til at tjene som en vehikelkontrol. Store stamopløsninger ved -20 ° C. Til denne protokol, vil fostre udsættes for 1 uM og 10 uM BPA, 18,5 nM og 1,85 uM genistein, 367 nM østradiol (positiv kontrol) og køretøj (0,1% DMSO, negativ kontrol). ADVARSEL: Kemikalier såsom BPA og østradiol er farligt og kan have skadelige virkninger på den menneskelige foster. Håndtag hormonforstyrrende stoffer med omhu og altid bruge en ordentlig personlige værnemidler. På dagen for behandlingen, tø forberedt lager kemiske opløsninger. Fortyndes 1:1000 ved pipettering af 1 ml E3B + PTU i et 1,5 ml mikrocentrifugerør og tilsætning af 1 ml af stock kemisk opløsning. Vortex kraftigt. Fortyndet DMSO 1:1000 i E3B + PTU som et køretøj kontrol. Brug 1 ml E3B + PTU i et 1,5 ml mikrocentrifugerør som en ubehandlet kontrol. Ved hjælp af en stor boring plast overførselspipetten, overføre embryoner fra petriskåle i hver brønd på en 96-brønds plade, 3 embryoner pr godt, 3 brønde pr tilstand. For at forhindre fordampning under langvarig behandling, udelade embryoner fra ydre rækker og kolonner af pladen (rækker A og E, kolonne 1 og 12). Ydre brønde kan fyldes med 300 pi E3B + PTU. Mærk pladelåget korrekt. Fjern medier fra hver brønd med en fin tippet plast overførselspipetten. Arbejde hurtigt for at undgå udtørring embryoner. Tilsæt 200 pi af behandlingsopløsning til tilsvarende godt. Sæt låget underneath pladen som en guide til at sikre tilsætning af behandlinger ind i de brønde. Vortex hvert rør før pipettering at distribuere kemikaliet i opløsning. Visuelt bekræfte hvert foster er i behandlingen løsning. Hvis embryoner er på siden af ​​brønden, skal du bruge en ren overførsel pipette til at vaske dem i godt med behandlingen løsning. Pladen anbringes i inkubatoren ved 28,5 ° C. Embryoner vil blive analyseret for fluorescens ved 72 HPF. 3.. Automated Imaging af embryoner i 96-brønds plader Bedøver embryoner ved tilsætning af 10 pi af 4 mg / ml tricaine til hver brønd. BEMÆRK: Bedøver embryoner før billeddannelse. Ved 24-96 HPF, zebrafisk udstille spontan bevægelse og en startle reaktion på den ændrede lyskilde under billedoptagelse. Bedøve embryoner reducerer bevægelse under billedbehandling. Anbring 96-brønds plade i motoriseret trin og kalibrere scenen. Brug Zeiss Zen Blå 2011 software til mikroskopi automatiskpå og kontrol, skal du vælge prøven carrier, og vælg brønde 96. Vælg Kalibrer. Følg den trinvise retninger at kalibrere scenen. BEMÆRK: Du må ikke fjerne markeringen knappen fliser efter dette trin. Hvis knappen fliser er markeret, kan indstillingerne for kalibrering tabt, og 96 brønde skal blive justeret. Ved hjælp af en 10x objektiv og lysfelt (BF) om, at identificere en positiv kontrol foster og indstille eksponering indstillinger passende til BF og GFP-kanaler, og sørg for, at fluorescens signalet ikke mætte kameraet. Fokusere på et enkelt foster og programmere mikroskop til at erhverve 3 af total Z-sektioner, et billede 50 mM ovenfor, og en 50 um under det aktuelle fokalplan. BEMÆRK: Fordi forskellige væv besætte forskellige fokusplaner, vil det sikre, at der for hver zebrafisk billeder er taget med hjertet og leveren i fokus. Indstille softwaren parametre for at erhverve en flisebelagt billede ved hjælp af GFP og BF Channels. Under fanen erhvervelse, skal du vælge avanceret setup. Vælg fliser regioner, så fliser. Vælg cirklen godt mulighed. BEMÆRK: Fliser bruges til at skabe et sammensat billede af hver brønd. En enkelt field-of-view indfanger kun en lille del af hver brønd. Fliselægning funktionen kan automatisk fange flere tilstødende marker-of-view fra hver brønd, at skabe et sammensat billede af hele godt. Det er derfor muligt at automatisk at fange 96 sammensatte billeder per plade, hvor hver sammensat billede indeholder flere dusin individuelle billeder fra en enkelt brønd. Vælg transportør og fyld faktor 90%. Valg af en fyldningsfaktor på 90% vil fange flere billeder af de udvalgte boringer, således at 90% af arealet af hver brønd vil være synlig i det sammensatte billede. BEMÆRK: Når der vælges fyldningsfaktor vil et diagram vises repræsenterer det område, der skal afbildes. Vælg en procentdel, der vil omfatte det område af brøndensom er passende for eksperimentet. Under indstillinger, skal du vælge den ønskede mængde overlap. BEMÆRK: Når sammenstrikke fliser til en enkelt repræsentant billede, et overlap på 5-10% giver mulighed for en jævn søm mellem billeder. Men hvis billedet syning er unødvendig anvendelse af en 0% overlapning vil reducere afbildningstiden. Brug 90% fyldningsfaktor og 5% overlap, et sammensat billede af en enkelt brønd består af 59 individuelle billeder. Start billeddannelse. Mikroskopet vil automatisk hente billeder. Manuelt inspicere sammensatte billeder af hver beholder for vævs-specifik fluorescens (figur 1). BEMÆRK: Det er bedst at starte med den positive kontrol for at bekræfte, at den kemiske eksponering arbejdede før observere eksperimentel behandling brønde. 4.. Manuel Billedoverførsel af embryoner i 96-brønds plade BEMÆRK: For at bekræfte resultater ved at bruge en objektiv 20x lang arbejdsafstand til acdarder kræver mere detaljerede billeder manuelt (figur 2). Ved hjælp af en 20x objektiv og lysfelt (BF) om, at identificere en positiv kontrol foster og indstille eksponering indstillinger for BF og GFP-kanaler korrekt, og sørg for at fluorescens signalet ikke mætte kameraet. Identificere individuelle embryoner og tage billeder manuelt. Bemærk: Når indstillingerne eksponering er blevet udvalgt til den positive kontrol embryo, ændrer ikke indstillingerne. Dette giver mulighed for en sammenligning af fluorescens intensitet som hvert billede er taget til fange under ensartede betingelser.

Representative Results

Figur 1 viser sammensatte billeder fra individuelle brønde i en 96-brønds plade. Hver sammensatte billede består af 59 individuelle billeder med 5% billede overlap. Bemærk, at de levende zebrafisk er orienteret tilfældigt inden for hver brønd, men vi er i stand til at skelne fluorescens i hjertet fra leveren. Lysfelt billeder er nyttige som henvisninger til at vurdere zebrafisk orientering og visualisere morfologiske abnormiteter (figur 1A og 1C). Automatiseret billedbehandling ve…

Discussion

Denne protokol beskriver en enkel metode til automatisk billede vævsspecifik fluorescens i zebrafisk embryoner. Protokollen blev udviklet ved hjælp af et Zeiss Axio Observer. Z1 Zen Blå 2011 software, men teknikken kan tilpasses ved hjælp af en inverteret mikroskop med en motoriseret trin og mikroskop control software, der kan udføre flisebelægning at skabe sammensatte billeder. Udstyre et inverteret mikroskop med en motoriseret scene kan give en praktisk, billigere alternativ til at købe specialudstyr til high-c…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Vi takker Susan Farmer og personale UAB zebrafisk forskning facilitet for zebrafisk pleje. Finansiering fra startfonde fra Institut for Farmakologi og Toksikologi.

Materials

Plastic transfer pipettes; wide boreFisher13-711-23
Plastic transfer pipettes; fine tipFisher13-711-26
96-well, round, flat bottom platesFisher21-377-203
100 x 35 mm platesFisher08-757-100D
35 x 60 mm platesFisher08-757-100B
Dumont #5 fine forcepsFine Science Tools11254-20tip dimensions 0.05 x 0.01 mm, for manually removing chorions from embryos
Tricaine methanesulfonateSigma AldrichA5040-25Gsee Zebrafish Book for recipe (http://zfin.org/zf_info/zfbook/chapt10.html#wptohtml63) 
1-phenyl 2-thiourea (PTU)Sigma AldrichP7629-10GPrepare 20 mM stock (100x) and use at 200 μM in E3B 
Zeiss Axio Observer Z1Carl ZeissProtocol requires an inverted fluorescence microscope with a motorized stage
20x long working distance objectiveCarl ZeissWe use an objective with 0.4 NA and 8.4 mm working distance
Axiocam HRm digital cameraCarl Zeiss
ZenBlue 2011 microscope control softwareCarl ZeissProtocol requires microscopy automation and control software to enable capturing of tiled images using a motorized stage
Methylene BlueSigma AldrichMB-1; 25 gramsmake 2% solution in RO water for use in E3B (below)
E3B60X E3 SOLUTION:<br/> NaCl&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; – 17.2 grams<br/> KCl&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; – 0.76 grams<br/> CaCl<sub>2</sub>-2H<sub>2</sub>O&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; – 2.9 grams<br/> MgSO<sub>4</sub>-7H<sub>2</sub>O&nbsp; – 4.9 grams or MgSO<sub>4</sub> – 2.39 grams<br/> Dissolve in 1 liter Milli-Q water; store in sterile 1 liter bottle.<br/> <br/> 1X E3B SOLUTION FOR ZEBRAFISH:<br/> 60X E3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150 ml<br/> 2% methylene blue&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100 &mu;l&nbsp;<br/> Bring to 9 liters with Milli-Q water<br/> &nbsp;

References

  1. Molina, G., Watkins, S., Tsang, M. Generation of FGF reporter transgenic zebrafish and their utility in chemical screens. BMC Developmental Biology. 7, 62 (2007).
  2. Perz-Edwards, A., Hardison, N. L., Linney, E. Retinoic acid-mediated gene expression in transgenic reporter zebrafish. Developmental Biology. , 89-101 (2001).
  3. Gorelick, D. A., Halpern, M. E. Visualization of Estrogen Receptor Transcriptional Activation in Zebrafish. Endocrinology. 152, 2690-2703 (2011).
  4. Tsang, M. Zebrafish: A tool for chemical screens. Birth Defects Research Part C: Embryo Today: Reviews. 90, 185-192 (2010).
  5. Peravali, R., et al. Automated feature detection and imaging for high-resolution screening of zebrafish embryos. Biotechniques. 50, 319-324 (2011).
  6. Walker, S. L., et al. Automated reporter quantification in vivo: high-throughput screening method for reporter-based assays in zebrafish. PLoS One. 7, (2012).
  7. Vogt, A., et al. Automated image-based phenotypic analysis in zebrafish embryos. Developmental Dynamics. 238, 656-663 (2009).
  8. Vogt, A., Codore, H., Day, B. W., Hukriede, N. A., Tsang, M. Development of automated imaging and analysis for zebrafish chemical screens. J. Vis. Exp. , (2010).
  9. Gruber, C. J., Gruber, D. M., Gruber, I. M., Wieser, F., Huber, J. C. Anatomy of the estrogen response element. Trends in Endocrinology and Metabolism. 15, 73-78 (2004).
  10. Rovira, M., et al. Chemical screen identifies FDA-approved drugs and target pathways that induce precocious pancreatic endocrine differentiation. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 108, 19264-19269 (2011).
  11. Westerfield, M. The Zebrafish Book: A guide for the laboratory use of zebrafish (Danio rerio). , (2000).
Semi-automated Imaging of Tissue-specific Fluorescence in Zebrafish Embryos

Play Video

Cite This Article
Romano, S. N., Gorelick, D. A. Semi-automated Imaging of Tissue-specific Fluorescence in Zebrafish Embryos. J. Vis. Exp. (87), e51533, doi:10.3791/51533 (2014).

View Video