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Identificazione delle proteine ​​partner di interazione in cellule di mammifero Uso SILAC-immunoprecipitazione quantitativi Proteomica
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Identification of Protein Interaction Partners in Mammalian Cells Using SILAC-immunoprecipitation Quantitative Proteomics
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Identificazione delle proteine ​​partner di interazione in cellule di mammifero Uso SILAC-immunoprecipitazione quantitativi Proteomica

DOI:
10.3791/51656-v

•

12:53 min

•

July 06, 2014

•

,
1Division of Virology, Department of Pathology,University of Cambridge

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:49Harvesting of SILAC-labeled Cell Lysates
  • 03:39Binding Lysate to Anti-GFP Beads
  • 04:45Preparation of Samples for MS Analysis
  • 06:11Data Analysis I: Understanding the Results and Removal of Low-confidence Identifications
  • 07:36Data Analysis II: Selecting High Confidence Interactions for Further Study
  • 08:58Data Analysis III: Merging Replica Datasets
  • 10:59Results: Identification of Translation Initiation Factor – Binding Proteins
  • 12:22Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Esperimenti di immunoprecipitazione SILAC rappresentano un potente mezzo per scoprire nuova proteina: interazioni proteina. Consentendo l'accurata quantificazione relativa abbondanza di proteine ​​sia nel controllo e campioni di prova, veri interazione può essere facilmente distinto da contaminanti sperimentali e interazioni bassa affinità conservata attraverso l'uso di condizioni di buffer meno stringenti.

Tags

SILACImmunoprecipitationQuantitative ProteomicsProtein-protein InteractionsEIF4AIEIF4AIIMass SpectrometryData AnalysisStable Isotope LabelingAffinity Purification

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