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फ्लैग-बायोटिन टैंडेम शुद्धि द्वारा मध्यस्थता किए गए क्रॉस-लिंकिंग और इम्यूनोप्रिपिपिटेशन द्वारा प्रोटीन-आरएनए इंटरैक्शन की ट्रांसक्रिप्टोम-वाइड प्रोफाइलिंग
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Transcriptome-Wide Profiling of Protein-RNA Interactions by Cross-Linking and Immunoprecipitation Mediated by FLAG-Biotin Tandem Purification
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फ्लैग-बायोटिन टैंडेम शुद्धि द्वारा मध्यस्थता किए गए क्रॉस-लिंकिंग और इम्यूनोप्रिपिपिटेशन द्वारा प्रोटीन-आरएनए इंटरैक्शन की ट्रांसक्रिप्टोम-वाइड प्रोफाइलिंग

DOI:
10.3791/60730-v

•

08:46 min

•

May 18, 2020

•

, ,
1Tsinghua-Peking Center for Life Sciences, School of Medicine and School of Life Sciences,Tsinghua University, 2Department of Molecular Biology,University of Texas Southwestern Medical Center

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:41Crosslinking
  • 02:44Immunoprecipitation
  • 05:31Dephosphorylation and PNK Treatment
  • 06:53Results: WDR43 and LIN28 FbioCLIP-seq
  • 08:17Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

यहां हम स्तनधारी कोशिकाओं में आरएनए-बाइंडिंग प्रोटीन (आरबीपीएस) के आरएनए लक्ष्यों को निर्धारित करने के लिए फ्लैग-बायोटिन टैंडेम शुद्धि के साथ Fbioक्लिप-एसईक्यू नामक एक संशोधित क्लिप-एसईक्यू प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं।

Tags

Protein-RNA InteractionsCLIP-seqFLAG-BiotinTranscriptome-wide ProfilingRBPsMammalian CellsDirect Protein-bound RNAsIsotope-freeSDS-PAGEMembrane TransferMouse Embryonic Stem CellsUV Cross-linkingCell LysisDNase I TreatmentFLAG BeadsFLAG Peptide Elution

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